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第36章rna的生物合成和加工
第36章 RNA的生物合成和加工 本章提要 1、DNA指导下的RNA的生物合成 即转录:以DNA为模板合成RNA 2、RNA的转录后加工 通过一系列加工和修饰过程成为成熟的,具有功能的RNA分子的过程。 3、RNA指导下的RNA和DNA合成 即RNA复制和逆转录 一、DNA指导下的RNA合成(转录) 1、DNA指导下的RNA聚合酶 2、启动子和转录因子 3、终止子和终止因子 4、转录的调节控制 5、RNA生物合成的抑制剂 转录单位 1、RNA转录起始于DNA模板一个特定起点,并在另一个终点终止,此转录区域为转录单位。 2、一个转录单位可是多基因,也可是单基因。 3、转录起始由启动子控制,终止由终止子控制,转录通过DNA指导由RNA聚合酶实现。 (一)DNA指导的RNA聚合酶 1、由RNA聚合酶催化的反应 NTP+(NMP)n RNA聚合酶 (NMP)n+1 + PPi RNA 延伸的RNA 2、DNA是RNA合成的模板 (1)用于转录的那条DNA链为模板链,或称负链;对应的链为编码链,即正链;转录方向为5’?3’。 (2)转录过程中形成局部DNA-RNA杂交分子,转录后DNA重新形成双螺旋。 3、RNA聚合酶有多种亚基,每种亚基具有特定功能 原核生物RNA聚合酶 举例:原核生物RNA聚合酶各亚基性质与功能 (1) 原核生物中由一种RNA聚合酶催化所有RNA的合成 (2)RNA聚合酶全酶由核心酶(?2、?、?’ 亚基)和??亚基组成,还有?与两个Zn原子 (3)核心酶(?2、?、?’ 亚基)只能延长RNA链,不具起始合成能力;不同细菌?亚基不同;?亚基在决定RNA聚合酶起始转录中起关键作用; Zn原子与?’ 亚基联结; ?亚基目前功能未知 大肠杆菌RNA聚合酶 RNA转录延伸期转录泡模型 转录过程 1、识别: ?因子,转录泡 2、起始:第一个形成的核苷酸为pppG或pppA 3、延伸:核心酶(?2、?、?’ 亚基) 4、终止:RNA聚合酶在NusA因子帮助下识别转录终止信号,离开模板 真核RNA聚合酶 根据酶对?-鹅膏蕈碱的敏感性分为三种: 1、RNA聚合酶I:转录形成5.8S rRNA,18 S rRNA,28S rRNA ——对?-鹅膏蕈碱不敏感 2、RNA聚合酶II:转录形成蛋白质基因mRNA和大多核内小RNA ——对?-鹅膏蕈碱敏感 3、RNA聚合酶III:转录形成小RNA: 5S rRNA,tRNA等——对?-鹅膏蕈碱中等敏感 * ?-鹅膏蕈碱是一种毒蕈产生的八肽化合物,对真核生物有较大毒性,但对细菌RNA聚合酶只有微弱抑制作用。 (二)启动子和转录因子 1、启动子(Promoter) :DNA上与转录起始相关,RNA聚合酶与之专一结合并起始转录的核苷酸顺序。 2、转录因子:RNA酶转录需一系列蛋白因子帮助,其作用或是识别DNA上的作用位点,或是识别其它因子,或是识别RNA聚合酶。 3、转录单位起始点为+1,起始点左侧为上游,用负值表示;向后为下游,用正值表示。 原核生物启动子结构 真核生物的启动子 1、有三类:分别由RNA聚合酶I、II、III转录。 2、真核生物启动子由转录因子而不是由RNA聚合酶识别,多种转录因子和RNA聚合酶在起点上形成前起始复合物而促进转录。启动子通常由一些短的保守序列构成,被适当种类的辅助因子识别。 1、I类启动子:控制rRNA前体基因的转录;由两部分保守序列构成:核心启动子(-45?+20和上游控制元件(- 108?-107);RNA聚合酶I对其转录需UBF1和SL1两种因子。 2、III类启动子:为RNA聚合酶III识别;控制5S和tRNA及胞核、胞质小RNA基因的的转录;启动子位于转录起点下游,即在基因内部——基因内启动子。 3、II类启动子:涉及众多编码蛋白质的基因表达控制;包含四类控制元件:基本启动子,起始子,上游元件和应答元件。 (1)基本启动子:TATA框或Goldberg-Hogness框(-25至-30),是RNA聚合酶和通用因子形成起始复合物的主要装配点。功能与RNA聚合酶定位有关,DNA在此解链并决定转录的起始位置。 (2)起始子:转录起点处的保守序列。A:+1 上述基本启动子和转录因子对RNA聚合酶II转录是必要的,但只能给出微弱的转录水平。 (3)上游元件:普遍存在的有:CAAT框,GC框和八聚体框等。其与转录因子相结合可增强转录水平。 (三)终止子和终止因子 1、终止子:提供转录终止信号的序列。 原核生物的终止子前有一回文结构,产物的RNA形成由茎环构成的发夹结构; 2、终止因子:协助RNA聚合酶识
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