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强优势玉米杂交豫玉22雌穗均一化cDNA文库的构建与鉴定.pdf
摘要
本工作通过Trizol
Reagent分离了强优势玉米杂交种豫玉22关键发育时期一雌穗分化时期
(生长锥伸长和小穗分化、小花分化、花丝始伸和果穗增K=)一的总RNA,反转录合成cDNA。
构建了均一化eDNA文库,为进一步研究和分离与杂种优势相关的基因构建了技术平台。在雌穗
为187、1.86、1.85和1.99,电泳检测显示】8S、28SrRNA条带清晰,且28S亮度明显大于】8s。
1
分别以Not
J酶切,cDNA
%琼脂糖凝胶电泳检测:两条链最长可达5kb。在双链cDNA两段加接头,经过Not
90%、87%、85%和93%,克隆数目分别为:2.7×10’、6.4×104、3.1xlO’和2.1×104,每
kb、1.4kb和13kb。
个独立库随机挑取200个克隆,PCR检测插入片断长度平均为1.2kb、1.3
l、BamHl先后酶切,单酶切后用Klenow
豫玉22基因组DNA分别用EcoR Fragment和
取两份均匀混合的体系先预杂交,接着四个独立cDNA文库各取10ug加入进行杂交。结束后,
洗脱下杂交上的部分,复性转化生成3×104个克隆的均一化cDNA文库。挑取其中200个克隆
检测,插入片断平均大小是1.3kb,其大小分布与独立cDNA文库一样,来发生改变。随机挑取
1 ESTs,11.2%的序列含有两个或两个以上的拷贝,
50个克隆进行测序,81.6%的序列为unique
它们主要来自多基因家族转录本,一定程度上证明了此均一化文库的均一化是有效性。
关键词:cDNA文库,均一化cDNA文库,玉米雌穗分化,RNA提取,eDNA合成
Abstract
are the
In thetotalRNAsofmaize Y22’earsthat
this hybrid duringimportantperiod-ear
study
isolatedTrizol thecDNA construct
synthesis strands,then
using Reagent,and
developmentperiod-were
thenormalizedcDNA isthebasisforthe aboutheterosis.TheRNAratiosof
library,which studygenes
was1.87、1.86、1.85andl.99
OD260/OD2800ffourperiods
thefirststrandcDNAwithNot1 anddoublecDNAstrandswere
into primer-adapter synthesizedusing
strand method.Theresultsof showedthatthe
replacement 1%agrasegel longestsynthasizedfragment
be twoendsofthecDNAswere witha withNot
could5kb.The
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