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三个小麦新品种溶蛋白基因序列分析.pdf
三个小麦新品种醇溶蛋白基因序列分析
研究生:刘千
指导老师:郑有良教授
摘 要
本文根据已报道的小麦小、p和∞.醇溶蛋白基因保守区序列,分别设计特
异引物,采用PCR克隆的方法,对小麦新品种“川农16”、“良麦2号”和“良
麦3号”的相应序列进行克隆测序与分析,其主要结果如下:
1.从3个供试材料中克隆到11条不同的a-醇溶蛋白基因序列。其中从“川农
典型的a-醇溶蛋白基因结构,其重复区开头可分出5个氨基酸残基的N·末端,
根据密码子可推导出较为一致的重复单元PF/YPQPQ,重复区主要差异在于
重复单元PFPQPQL在不同基因出现频率不同。所有序列的两个多聚谷氨酰
胺区除谷氨酰胺外还有其余氨基酸出现,密码子大多是第1个碱基的替换。
在特征区6个保守的半胱氨酸残基中,a-CNl6-6的第4个半胱氨酸残基被精
n的前端均有额外的半胱氨酸残基代替了原来的丝氨酸(s),使半胱氨酸残
基数变为奇数。相对其它两个品种,“川农16”中所得序列出现多余半胱氨
酸的频率较高,表现出独特性。
2.从“川农16”中克隆到6条不同的p醇溶蛋白基因序列,分别命名为7.-CNl6-1、
提前终止密码子,均为假基因。序列分析表明,5’旁侧序列上有一致的几个
“TATA”元件,3’旁侧序列有一个可能的多聚腺嘌呤信号,在基因编码区具
有典型Y.醇溶蛋白基因的结构特征,重复区可划分出较为一致的重复单元
PFPQl.2(PQQ)1-2,且重复单元长度变化较大。在多聚谷氨酰胺区各序列长度
差异也较大。序列),-CNl6-3在重复区有1个多余半胱氨酸残基,使半胱氨
酸总数变为奇数,而其它序列只有8个保守的半胱氨酸残基。序列比对可以
看出,所得序列与小麦属各物种T.醇溶蛋白基因的相似性较高,而与来源于
黑麦y-secalin基因的相似性只有50%左右。
有提前终止密码子,∞一CNl6-60发生了移码突变。从“良麦2号”获得1条
基因和基因片段都属m-2型,其重复区的脯氨酸含量约30%,谷氨酰胺含量
超过40%,其中基因co-LM2.7谷氨酰胺含量高达44.8%。序列重复单元长短
不一,氨基酸变化丰富,但都有较为一致的重复单元PFPQl-2(PQQ)1.2以不同
频率连续出现。序列均没有可形成分子内或分子间二硫键的半胱氨酸残基。
进一步序列比对表明,它们与来源于普通小麦和山羊草的0卜醇溶蛋白基因相
相似性也达到70%。
关键词:小麦;新品种;醇溶蛋白;川农16:良麦2号;良麦3号;基因克隆
II
ofGliadinGenesfromThreeNewWheatVarieties
SequenceAnalysis
。
Abstract
totheconserved
According regions genesequences,the
of洳,p,and∞·gliadin
were to thefull from
gene-specificprimersdesignedamplify genecodingregions
three
newwheat 2and 3.The
varieties,includingChuannong16,LiangmalLiangmai
as
PCR were resultswere
amplyfiedfragmentssequenced,andinve
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