大足黑山羊地方类群多胎性及和周边山羊品种亲缘进化关系分子标记的研究.pdfVIP

摘要 南江黄羊、川东白山羊、板角山羊、波尔山羊为研究对象，采用PCR—RFLP方法分析 了两个候选基因在这些山羊品种(类群)中的多态性。对山羊基因组进行扩增．得 到BMPR IB、BMPl5(FecX“)基因片段，均与绵羊的同源序列仅有一个碱基的差别； 末扩增出BMPl5(FecXl)基因片段。经Ec047 I、SpeI内切酶分别消化后电泳检测 并抽样克隆测序验证，未检测出BMPR IB、BBPl5(FecX”)基因突变位点。 最后．为分析大足黑山羊地方类群及周边山羊品种的亲缘进化关系，利用所选 45个微卫星标记中多念性较好的、分布在27条染色体上的30个微卫星标记，对6 个IJ DlSPAN等分析软件计算等位基因频率及反映群体变异的多态信息含量(丹f)、平均 杂合度(肋、有效等位基因数(他)、固定指数、基因分化系数等相关指标，并根据 Nei氏几何遗传距离，利用UPGMA法进行了聚类分析，评估其品种内遗传变异和品种 间遗传关系。结果表明6个山羊品种(类群)在30个微卫星位点中： (1)共检测到288个等位基因，平均每个位点检测出9．6个等位基因。 (2)以等位基因频率为基础，得出各位点的平均多态信息含量值在0．490～0．879 之削；甲均杂台度在0．601～0．910之问，平均有效等位基因数在2．55～11．55之间。 态位点，可作为有效的遗传标记用于6个Ll[羊品种(类群)亲缘进化关系分析。 (3)金堂黑山羊遗传多样性最丰富，群体多态信息含量、平均杂合度和有效等位 基因数分别为0．777、0．819和6．54：大足黑山羊各项指标相对较低，分别为0．736、 0．787和5．57。多念信息含量、群体杂合度及有效等位基因数反映多态性的‘致性 较好。 (4)拥有89个优势等位基因，除板角山羊外的其他5个山羊品种(类群)在11 个位点上共检测到20个特有等位基因。 (5)总群体的平均遗传分化系数是0．045。 (6)根据Nei氏几何遗传距离(Da)和标准遗传距离Ds判断，与大足黑山羊亲缘 关系由近及远为：金堂黑山羊、南江黄羊、板角山羊、川东白山羊、波尔山羊，与 群体间遗传分化系数计算结果完全相同。对6个品种(类群)蒙类分析表明，金堂 黑山羊与南江黄羊的首先聚类在一起，然后依次与板角山羊、川东白山羊、大足黑 山羊和波尔山羊聚类。各山羊品种(类群)的聚类关系与其来源、育成史及地理分 摘要 4 布基本一致。 (7)通过聚类分析，将大足黑山羊核心群90只羔羊母羊可分为3个大组，6个小组 和11个聚类群。聚类结果与现有生产记录完全相同，表明Nei氏几何遗传距离(Da) 制作uPG眦树状聚类图能准确对个体进行分类。 通过上述三方面的研究，在大足黑山羊群体内获得了的1个多胎性状分子标记： 通过对山羊基因组进行扩增．得到BMPR—IB、BMPl5(FecX“)基因片段，未扩增出 BHPl5(FecX’)基因片段，经Ec047I、SpeI内切酶消化后电泳检测并抽样克隆测序验 证，基因片段与绵羊同源序列均只有一个碱基差别，同源性很高，但未检测出 BMPR 有与绵羊相同的突变特性。此外，通过对大足黑山羊地方类群及周边山羊品种的亲 缘进化关系的研究，认为大足黑山羊地方类群是一个独立存在的群体，与周边山羊 品种遗传距离较远。 关键词：大足黑山羊：多胎；AFLP：差异片段；候选基因；微卫星；遗传距离 SummaW 5 Summary Black Dazu Goat onTieshan Populations(DBGP)，distributingTown，Jijia Townand Town Town，GaoshengTown，SanquTown，longshiZhuxi of