epc10膜片钳patchmaster数据处理分析2.pdfVIP

EPC10 膜片钳PatchMaster 数据处理分析 PatchMaster 生成以.dat 为后缀格式的数据，用相应的记录软件PatchMaster 可以直接打 开，尽管在PatchMaster 提供的 Online Analysis 功能可以对感兴趣的参数数据进行获取并输 出，但是对某些数据的分析还需借助第三方软件处理后再进一步的分析；在此结合实际使用， 总结一下对突触后电流发放及多个动作电位如何更好的分析，这两种数据的特点是需要对多 个电流或电位的峰值、阈值、时程等多个参数进行获取，目前国内处理这类数据主要使用 MiniAnalysis 软件，因此如何运用MiniAnalysis 转换并处理以上两种数据进行总结，供大家 参考。 1．数据初步输出 1.1 在PatchMaster Replay 窗口打开数据时，可以看到数据是以树型结构排列的，如果 这一个文件下数据太多，但是需要分析的数据往往只要某一个，所以先选定要分析的数据， 在Oscilloscope 看到要分析的数据 1.2 将需要分析的数据以Pulse 格式输出，在Replay 菜单下选定输出格式为PULSE v8.6 ， 之后Export 该数据， 选好路径，保存该数据就可以了，这样主要是为了使要分析的数据成为单独的一个data， 便于后续的转换和分析。 2 ．数据转换 在 安 装 了 MiniAnalysis 软 件 后 会 有 一 个 附 加 的 功 能 ABF Utility ，准备利用它进行数据转换，打开后找 到刚才保存下的数据，选中.dat 格式的文件，然后点击右侧Convert Known File to ABF， 此时会提示未知格式是否转换，选Yes ，出来个对话窗口，此窗口参数填写一定要正确，在 Sampling Interval 填写与Patchmaster 采集该数据时一致的采样率，这样确保转换出来的数 据X 轴正确，下面Unit 单位选择pA 或mV 与你采集的数据一致，Scaling Factor 确保Y 轴 一致，原始数据Y 值如果是电流值的话，在Gain 是1 情况下采集的信号，写0.001，Gain 2 写0.002 ，电压值的话0.01，以此类推，实际中多试几次确保转换后的Y 值与原始值想匹 配，在上述值都正确的情况下点击Convert to ABF，这样在主窗口的右侧出现转换后的数据， 至此，数据转换结束。 3 ．数据分析 通过上述方法转换后的数据可以直接用clampfit 或minianalysis 打开了，根据需要可以 选择适合的软件分析数据。在此，主要说一下MiniAnalysis 的使用。 打开MiniAnalysis 主程序，通过右侧Flies 打开转换后的文件一定要是.ABF 格式的， 通过调整左侧上方控件Gain 及左侧游标位置，及左下方x 轴大小将电流图调整合适。 此时选择右上方Analysis ，出现一些分析需要设定的选项，根据数据设置合理的选项进 行自动分析，下面的Analysis this window 点击会根据设定的相应值对事件自动分析在下方 就看到每个 events 的各个参数，可以根据初步得到的参数对以前设定的值进行调整，将所 要研究的Events 都包括进去，也可以用鼠标直接点击电流图中的各个Events 得到相应的参 数，这样接着在Analysis next window 或nonstop analysis 对所有数据自动分析完毕。 各个Event 参数可以选定复制到Excel、Origin、SigmaPlot 等数据分析绘图软件里进行 进一步的分析绘图。 该数据处理完毕后就形成一个处理后的数据，此时不能直接关闭 MiniAnalysis 软件， 否则此处理结果不会保存，可以选择另一个需要分析的数据，选Yes，这样就会出现一个.EVT 格式文件，这样以后就可以直接用MiniAnalysis 打开分析过的数据。