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三维定量结构_活性关系研究中的受体作用位点模型方法.pdf

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第 10 卷 第 1 期 化 学 进 展 V o l. 10 N o. 1 1998 年 3 月 PRO GR E SS IN CH EM ISTR Y M ar. , 1998 三维定量结构活性关系研究中的 受体作用位点模型方法 周家驹 陈红明 谢桂荣 任天瑞 许志宏 ( 中国科学院化工冶金研究所计算机化学开放实验室 北京 100080) 摘 要 综述了三维定量构效关系研究的必威体育精装版进展以及受体作用位点模型方法在 3 D 中的应用。重点介绍了 、 和 3 种新的建立受体作用位点模型的 Q SA R Com p a ss GERM R SM 算法, 这些方法对于受体的三维结构未知情况下的Q SA R 研究提供了新的思路。 关键词 受体作用位点模型 三维定量结构活性关系 3 - The Receptor Site M odel M ethod in D QSA R Re search Z h ou J iaj u   Ch en H ongm ing   X ie Gu irong  R en T ian ru i   X u Z h ih ong (L abo rato ry o f Com p u ter Ch em ist ry , In st itu te o f Ch em ica l M eta llu rgy , Ch in e se A cadem y o f Scien ce s, B eij in g 100080, Ch in a)   3 A bstract T h e recen t p ro g re ss o f th e D Q SA R re search an d th e app licat ion s o f th e 3 . , m etho d o f recep to r site m o del in D Q SA R re search h ave b een rev iew ed Com p a ss GERM an d R SM a lgo r ithm s fo r bu ild in g recep to r site m o del w ere in t ro du ced. T h e se m etho d s p ro v ide a n ew idea to th e Q SA R re search un der th e con d it ion th at th e th ree d im en sion a l st ru c tu re o f recep to r is unknow n.   ; 3 Key words recep to r site m o del D Q SA R 一、引 言 目前计算机辅助分子设计的研究取得了很大进展, 出现了不少用于辅助分子设计的计 算程序。按照是否已知受体的三维结构, 可把这些方法分为两大类别: 一类是依赖于受体 三维结构的方法; 一类是不依赖于受体三维结构的方法。第一类是在已知受体

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