中国家鸭的分子遗传多样性和其起源探讨.pdfVIP

第十一次全国畜禽遗传标记研讨会论文集 中国家鸭的分子遗传多样性及其起源探讨六 李慧芳1，陈宽维1，朱文奇1，薛素美2，宋卫涛1，王光瑛2 (1．中国农业科学院家禽研究所，扬州225003；2．福建农林大学动物科学学院，福州350002) 摘要：本研究测定了我国重点保护的8个家鸭品种及斑嘴野鸭的线粒体DNA D-loop区667bp序列， 分析了这8种家鸭的遗传多态性和起源．遗传多态性分析结果显示A、G．C、T稿基平均含量分别为 25．5％，15．3％，33．4％，25．8％；变异类型为转换和颠换，未发现觖失与插入．确定了20种单倍型，Hap2 (A7)为家鸭的主体卑倍型型，平均单倍型多样度为0．67136，平均核苷酸多样度为0．00192，攸县麻鸭 单倍型多样度、核苷酸多样度最高，8个品种之间双参数遗传距离为0．00056-0．00414，其中连城白鸭和 攸县麻鸭之间遗传距离最大．38种单倍型系统发生研究表明，8种家鸭都单一地起源于绿头鸭． 关键词：家鸭；D-loop区；遗传多样性；起源 鸭的起源与演化在学术界历来有两种看法。一是‘单元论’，即家鸭是由野鸭绿头鸭长期驯养而来，国外 学者多持此观点Il,21。另—种是“二元论’，即由绿头鸭和斑嘴鸭在我国不同地区单独驯养，或由绿头鸭与 斑嘴鸭自然杂交的杂种代驯养而来IⅢ。 线粒体DNA具有典型的母系遗传特征，重组现象很少发生，进化速度快，尤其是控制区(D-loop) 是非编码区，在进化过程中受环境的选择小，遗传变异大．是研究属内、种问遗传结构和系统进化的有 效的分子标记【3’4】，目前在动物的系统进化和遗传多样性等方面得到了广泛的应用p刀，目前，在分子水平 上研究我国家鸭起源的报道很多，但是中国家鸭的起源问题仍存在争议，因此，本研究选择了具有代表 性的国家重点保护的8个家鸭品种，通过测定线粒体DNA D-loop区序列，结合绿头鸭和斑嘴鸭序列分 析这些家鸭品种的遗传多样性和起源，不仅为我国地方鸭种的合理分类、保护及开发利用提供理论依据， 同时为家鸭的起源和遗传分化提供基础材料。 ． 1实验材料与方法 1．1实验材料 n-8)．采集血样时，保证每个个体都符合本品种特征，每个品种按照公母比例为l：l，并且尽量避免个 体间存在血缘关系。斑嘴鸭采自浙江省杭州萧山钱江水禽驯养繁殖场(萨5)。 1．2引物合成，DNA扩增和序列测定 线粒体DNA 5’乇rrAr几’GGr瞄麟筒fATCGI．G-3’，H7745’CC^T觚ACGCCAACCG“1℃-3’。 鸭线粒体DNA p．Idma,s(2．5mM，2．5 D-loopPCR反应体系：2．5山10xBuffer，2．5 IIIMg+(25raM)． 0．2Taq酶(5．U4d)25pmol／／．‘I的上下游引物各lpl，DNA模板(50ngpl)3．0山。PCR反应条件：95C 蚂毒金项目：国家自然科学基金项目(编号l tIlc bY 作者简介l李慧芳(1974-)．女，博士，副研究员．研究方向为水禽遗传育种．Tel：0514I}埘 E-mail：hjphoo ．．!D02@yall∞．gom．all rain：4C保存。使用柱式DNA胶回 都在EppendorfMastercycler扩增仪上进行。35次；72C延伸10 PRISM3730 收试剂盒进行DNA的回收纯化。纯化好的PCR产物经测序反应后直接进行测序，在ABI