实验四文献信息的查找与管理.docVIP

实验四、文献信息的查找与管理（3学时） 目的：以PubMed为例，学会文献数据库的基本查询检索方法，并将下载的文献信息进行有效的管理。 内容：有效地使用NCBI PubMed提供的各种主要功能，查询并下载相关课题或研究方向的论文文摘与文献全文，并利用Reference Manager将文献进行有效的管理。 熟悉PubMed各功能菜单的使用。 任务：查找目前蛋白激酶国际上必威体育精装版的研究动态。 在NCBI主页上将Search项的内容改为PubMed，在随后的检索框中输入检索词： kinase。 对检索词进行出版时间从2004.11.01 – 2005, 02, 08的范围限定。(三种方法) 直接输入检索式：kinase AND (2004/11/01[PDAT] : 2005/02/08[PDAT])。 利用limits功能键，填写出版物出版时间publication Data选项内容。 利用Preview/index功能键，在页面组合检索的下拉菜单中选择Publication Data，检索框内填入：2004/11/01：2005/02/08，点击下方的AND操作符（可发现输入的检索词被加在了主检索框检索词的后边），点击Preview. 三种方法达到的检索结果是一样的，若要三种方法都试，可在试完一种方法后利用History或Preview回到最初的kinase检索结果状态。 继续限定检索结果为发表在Science或Nature期刊上。（同样可利用上述三种方法之一继续将检索范围缩小），点击Preview预览检索结果。 出什么问题了吗？是否检中记录比刚才的还要多很多？利用History或者Preview查看上次检索的简单检索式，或者直接点击Detail查看你的检索式。发现问题了吧，检索式中为Science OR Nature[Journal]，而不是我们想像的Science [Journal] OR Nature [Journal]。 利用History返回第二步的检索结果，点击Details查看具体的检索式，在检索式后面加上： AND （Science [Journal] OR Nature [Journal]），点击下面的Search键，得到结果后将检索式利用检索式下面的URL，利用浏览器的收藏-添加到收藏夹进行保存以备后用。 在以summary 格式显示的检索结果中，前面带标记的为有文摘内容的，前面带标记的为从PubMed可得到免费全文。从检索结果中找到Genome-wide survey of protein kinases required for cell cycle progression、Positional Signaling Mediated by a Receptor-like Kinase in Arabidopsis、Binding of brassinosteroids to the extracellular domain of plant receptor kinase BRI1三篇，将它们放到clipboard中去(利用Send to)。 点击Clipboard，从Display下拉菜单中选中Abstract，点击Display显示选中记录的文摘进行阅读。（也可以试验Display下拉菜单中的其它显示格式以了解不同格式的著录方法。） 点击plant receptor kinase这篇文献后面的Links，我们可以查看这一receptor kinase基因的相关信息，如知道BRI1这个蛋白是由拟南芥的哪个基因编码的，染色体定位在什么地方等。还可以知道这一基因在不同的表达谱中表达情况（GEO Profile）。点击Related Articles，我们可以得到一系列研究BRI1或plant receptor kinase的文章，选取感兴趣的文献放入clipboard以便于集中下载。 （注意：如果文献记录的Abstract格式前有“Full text article at …”字样或“free full text article at …”字样，一般我们就可以免注册得到该文献的电子全文（HTML格式及PDF格式，利用Adobe Acrobat 或Acrobat reader软件进行阅读）。但是，通常的做法是我们只利用电子期刊中的download to citation manager将文献相关信息导入Reference Manager或EndNote等文献管理软件中，而电子全文则先查询学校是否购买有此期刊的电子版，如果从国内得不到的情况下我们才考虑从国外网站上下载。当然如果能找到免费国外代理就不用这么麻烦了。） 进行全文文献的查找与下载，并利用Reference Manager进行管理。 从课程相关内容-