基础研究基于表达谱分析识别鼻咽癌血管生成及淋巴管生成的.pdfVIP

2012;32(11) 南方医科大学学报（J South Med Univ ） ·1553 · 基础研究 基于表达谱分析识别鼻咽癌血管生成及淋巴管生成的调控通路 1 1 2 马佳怡 ，黄 坤 ，黄仲曦 1 2 南方医科大学 第一临床医学院2006 级八年制，肿瘤研究所，广东 广州 510515 摘要：目的探讨鼻咽癌是通过调节哪些靶基因的表达影响血管生成和淋巴管生成。方法 以Sengupta 等通过基因芯片数据（其 中含10例正常鼻咽组织，31 例鼻咽癌组织）分析所得的831个鼻咽癌与正常鼻咽组织差异表达基因为基础,根据必威体育精装版的基因组 信息以及设定差异表达值的最小阈值260 ，筛选出246 个有效基因。对这246 个基因进行基于文献挖掘的基因功能分析和网络 构建，最后进行通路分析。结果 246 个基因与鼻咽癌、EB 病毒、转移、血管生成、淋巴管生成、侵袭等关键词特异相关。其中，52 个基因已知与血管生成相关（P=0.00001），19个基因构成了血管生成基因网络（P=0.0042）；21 个基因已知与淋巴管生成相关 （P=0.00001），6 个基因构成了与淋巴管生成相关基因网络（P=0.0226）。包含PTGS2 在内的8个基因参与NFκB 信号通路已知 在小细胞肺癌中与血管生成密切相关（P=7.87E-07）。包含STAT1及CXCL10等在内的5 个基因参与了Toll 样受体通路（P= 0.00176）。结论 PTGS2 和NFκB 共同调控鼻咽癌血管生成，Toll 样受体信号通路可能与淋巴管生成密切相关。它们的相互作 用方式值得进一步研究。 关键词：鼻咽癌；基因芯片；数据挖掘；信号通路；血管生成；淋巴管生成 中图分类号：R739.6 文献标志码：A 文章编号：1673-4254（2012）11-1553-06 doi: 10.3969/j.issn. 1673-4254.2012.11.005 Analysis of angiogenesis and lymphangiogenesis signaling pathways based on gene expression patterns of nasopharyngeal carcinoma 1 1 2 MA Jiayi , HUANG Kun , HUANG Zhongxi 1Direct MD Class (8 years), Grade 2006, First Clinical Medical College, 2 Cancer Institute, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China Abstract: Objective To pinpoint angiogenesis- and lymphangiogenesis-related genes in nasopharyngeal carcinoma (NPC). Methods Based on the reported microarray data which identified 831 differentially expressed genes in NPC tissues and the latest genomic information, we selected 246 genes for analysis with the smallest differential expression threshold of 260. Gene function analysis and network construction was carried out based on literature mining for analysis of the signaling pathways related with angiogenesis and lym