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第 五 章 分子生物学研究法 本章主要内容 一、 重组DNA技术发展史上的重大事件 二、 基因操作的主要技术原理 三、基因克隆的载体系统 四、基因的分离与鉴定 一、 重组DNA技术发展史上的重大事件 1.40年代确定了遗传信息的携带者,即基因的分子载体是DNA而不是蛋白质,解决了遗传的物质基础问题; 2.50年代提示了DNA分子的双螺旋结构模型和半 保留复制机制,解决了基因的自我复制和世代交替问题; 3.50年代末至60年代,相继提出了中心法则和操纵子学说,成功地破译了遗传密码,充分认识了遗传信息的流动和表达。 重组DNA技术历史上的主要事件 (教材P148表) 基因工程的主要内容或步骤: 1. 从生物有机体基因组中,分离出带有目的基因的DNA片段。 2. 将带有目的基因的外源DNA片段连接到能够自我复制的并具有选择记号的载体分子上,形成重组DNA分子。 3. 将重组DNA分子转移到适当的受体细胞(亦称寄主细胞)并与之一起增殖。 4. 从大量的细胞繁殖群体中,筛选出获得了重组DNA分子的受体细胞,并筛选出已经得到扩增的目的基因。 5. 将目的基因克隆到表达载体上,导入寄主细胞,使之在新的遗传背景下实现功能表达,产生出人类所需要的物质。 二、 基因操作的主要技术原理 序:传统的方法--同位素标记、放射自显影技术的应用。 1. 核酸的凝胶电泳 ??? (1)基本原理:将某种分子放到特定的电场中,它就会以一定的速度向适当的电极移动。某物质在电场作用下的迁移速度叫作电泳的速率,它与电场强度成正比,与该分子所携带的净电荷数成正比,而与分子的磨擦系数成反比(分子大小、极性、介质的粘度系数等)。 ??? 在生理条件下,核酸分子中的磷酸基团是离子化的,所以,DNA和RNA实际上呈多聚阴离子状态。将DNA、RNA放到电场中,它就会由负极→正极移动。 (2)琼脂糖凝胶电泳 琼脂糖:红色海藻产物提取的多糖聚合物,经化学修饰的低溶点琼脂糖结构脆弱,低温下易熔化。 凝胶的分辨能力与凝胶的类型和浓度有关。凝胶浓度与凝胶介质孔隙大小呈反比,与分辨力呈正比。 在凝胶电泳中,一般加入溴化乙锭(EB)染色( EB 能插入到DNA或RNA分子相邻碱基之间并在300nm波长紫外光下发出荧光)。此时,核酸分子在紫外光下发出荧光,肉眼能看到约50ng DNA所形成的条带。 (3)脉冲电场凝胶电泳(PFGE) 在脉冲电场中,DNA分子的迁移方向随着电场方向的周期性变化而改变。 在标准PFGE中,第一个脉冲电场的方向与DNA移动方向成45度角,而第二个脉冲电场的方向与DNA移动方向在另一侧成45度角。(P155图) PFGE技术用于分离大分子量的DNA。对于较大分子的DNA,常用更多的脉冲次数来更换其构型和方位以分离之。 2. 核酸的分子杂交技术 ??? 在大多数核酸杂交反应中,经过凝胶电泳 分离的DNA或RNA分子,都是在杂交之前,通过毛细管作用或电导作用按其在凝胶中的位置原封不动地吸印 转移到滤膜上的。常用的滤膜有尼龙滤膜、硝酸纤维素滤膜,叠氮苯氧甲基纤维素滤纸(DBM)和二乙氨基乙基纤维素滤膜(DEAE)等。 核酸分子杂交实验包括如下两个步骤:?? 将核酸样品转移到固体支持物滤膜上,这个过程特称为核酸印迹转移,主要有电泳凝胶核酸印迹法、斑点和狭线印迹法、菌落和噬菌斑印迹法?? 将具有核酸印迹的滤膜同带有放射性标记或其它标记的DNA或RNA探针进行杂交。所以有时也称这类核酸杂交为印迹杂交。 3. 细菌的转化 ??? 所谓细菌转化,是指一种细菌菌株由于捕获了来自另一种细菌菌株的DNA,而导致性状特征发生遗传改变的生命过程。这种提供转化DNA的菌株叫做供体菌株,而接受转化DNA的寄主菌株则称做受体菌株。大肠杆菌是最广泛使用的实验菌株。在加入转化DNA之前,必须预先用CaCl2处理大肠杆菌细胞,使之呈感受态。Mg2+对维持外源DNA的稳定性起重要作用,质粒DNA中的抗生素是筛选标记。??? 对绝大多数hsdR-,hsdM-突变体菌株(k12),每ug DNA可得107-108个转化子。 4、分子克隆技术 (1)高质量mRNA的制备 ?? 应用Promega PolyAT tract mRNA Isolation System分离Poly(A)RNA。将dT)引物与细胞总RNA共温育,加入与微磁球相连的吸附物,用磁场吸附与PMP相连的Oligo(dT)-mRNA。 (2) 反转录成cDNA 可同时在反转录系统中加入Oligo(dT)12-18-mer及随机引物R6,以保证得到全长cDNA;应选用活性较高的反转录酶 应选用甲基化dCTP;应保证所获得双链cDNA的方向性。 5、PCR技术
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