云南3个地区中缅树鼩线粒体细胞色素b和D-loop区遗传多样性及系统进化研究.docVIP

 云南 3 个地区中缅树鼩线粒体细胞色素 b 和 D-loop 区遗传多样性及系统进化研究# 朱万龙，王政昆** 5 10 15 20 25 30 35 40 （云南师范学校生命科学学院，昆明 650500） 摘要：本研究对 3 个地方种群的 49 只样本的线粒体 Cyt b 基因全序列(1140bp) 及 33 只样 本的控制区 D-loop 基因区段（745bp）进行了序列测定。所有序列的同源排序分析表明：从 Cyt b 基因来看，多态性位点有 47 个，其中单变异位点（Singleton variable sites）位 点 23 个，简约信息位点（Parsimony informative sites） 位点 24 个。共定义了 24 个单 倍型，其中种群间的共享单倍型有 2 个（8.33 %)，其余均为某个种群所特有，单倍型多样 度（Hd） 范围为 0.80952 （剑川种群）-0.91532（禄劝种群），核苷酸多样度指数（Pi） 介于 0.00326（禄劝种群）到-0.00635（剑川种群）之间；从 D-loop 基因来看，多态性位 点有 18 个，其中单变异位点（Singleton variable sites）位点 8 个，简约信息位点（Parsimony informative sites） 位点 10 个。共定义了 16 个单倍型，无种群间的共享单倍型，单倍型 多样度（Hd） 范围为 0.76615（禄劝种群）-0.93333（丽江种群），核苷酸多样度指数（Pi） 介于 0.00269（禄劝种群）到-0.00583（丽江种群）之间。从各单倍型的 TCS 网络进化图显 示横断山种群位于分支的末端，表现出中缅树鼩由南向北的扩散模式，支持“岛屿起源”假 说。 关键词：生态学；中缅树鼩；遗传多样性 中图分类号：Q95 Study on mtDNA genetic diversity of Tupaia belangeri from Yunnan Province ZHU Wanlong, WANG Zhengkun (School of life science,Yunnan normal university, KunMing 650500) Abstract: In this paper，we examined DNA sequence variations in the mitochondrial cytochrome b gene (1147bp) and D-loop gene (745bp) gotten from 49 individuals of Luquan, Jianchuan, Lijiang in Yunnan province. There were 47 polymorphic sites, 23 singleton variable sites, 24 parsimony informative sites. There were 24 haploid. Hd were from 0.80952(Jianchuan) to 0.91532(Luquan), Pi were from 0.00326(Luquan) to 0.00635(Jianchuan) in Cyt b gene sequences. Based on D-loop gene, there were 18 polymorphic sites, 8 singleton variable sites, 10 parsimony informative sites. There were 16 haploid. Hd were from 0.76615 (Luquan) to 0.93333(Lijiang), Pi were from 0.00269(Luquan) to 0.00583 (Lijiang). Based on the TCS network chart, groups of Hengduan mountains region were located in the bottom of it, it indicated the diffuse mode of south to north, and it sustained the “islands origin” theory. Keywords: Ecology; Tupaia belangeri; genetic diversity 0 引言 中缅树鼩（Tupaia belangeri）属攀鼩目（Scandentia）树鼩科（Tupaiidae），为东洋界 热带亚热带特有类群，其分布从马来半岛北部一直延伸到我国的南部和西南部以及喜马拉雅