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2025年生物信息软件开发合同协议合同

合同协议

第一部分：前言

鉴于委托方（以下简称“甲方”）因业务发展需要，希望开发一套生物信息软件系统（以下简称“本项目”或“软件”），经友好协商，甲方委托开发商（以下简称“乙方”）进行本项目的软件开发工作，双方根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，本着平等互利、诚实信用的原则，达成如下协议，以资共同遵守。

第二部分：合同主体

1.甲方（委托方）：[甲方公司全称]

法定代表人/授权代表：[姓名]

地址：[甲方公司地址]

联系人：[姓名]

联系电话：[电话号码]

电子邮箱：[电子邮箱地址]

2.乙方（开发商）：[乙方公司全称]

法定代表人/授权代表：[姓名]

地址：[乙方公司地址]

联系人：[姓名]

联系电话：[电话号码]

电子邮箱：[电子邮箱地址]

第三部分：项目范围与要求

1.项目名称：[具体的生物信息软件开发项目名称]

2.软件概述：本项目旨在开发一套用于[简述软件的主要用途，例如：分析基因组测序数据、预测蛋白质结构、管理化合物信息库等]的生物信息软件。软件将实现以下主要功能模块：

(1)数据导入与预处理模块：支持从[具体格式，例如：FASTQ,BAM,VCF,SIF等]格式文件导入生物数据，提供数据清洗、格式转换、质量控制等预处理功能。

(2)核心分析引擎模块：集成[具体算法或分析方法，例如：序列比对算法、基因注释工具、机器学习预测模型等]，对输入数据进行[具体分析任务，例如：变异检测、功能富集分析、分类预测等]。

(3)结果可视化模块：提供[具体可视化形式，例如：热图、散点图、网络图、三维结构展示等]，以图形化方式展示分析结果。

(4)用户管理与权限控制模块：实现用户注册、登录、角色分配及不同数据和分析功能的访问权限管理。

(5)数据管理与检索模块：提供数据库接口，支持[具体数据管理功能，例如：样本信息管理、实验记录保存、结果归档等]。

3.技术要求：

(1)软件运行环境：支持在[具体操作系统，例如：LinuxCentOS7/Ubuntu20.04,WindowsServer2019]上运行。

(2)开发语言与框架：主要使用[具体编程语言，例如：Python3.9+]及[具体框架或库，例如：Django/Flask,Pandas,NumPy,Scikit-learn,Biopython,R语言及相关包]进行开发。

(3)数据接口：提供API接口或命令行工具，支持与其他[例如：实验室信息管理系统(LIMS)、云平台]进行数据交换。

(4)界面要求：开发Web图形用户界面（GUI），界面设计应简洁、直观、易于操作。

(5)性能要求：对于[具体数据量或复杂度描述]的数据集，核心分析任务的处理时间应不超过[具体时间限制，例如：5分钟]。

(6)安全性要求：需符合一般软件安全标准，保护用户数据和系统安全。

4.开发交付物：

(1)源代码：完整的、注释清晰的源代码，采用[具体版本控制工具，例如：Git]进行管理，并提供访问权限。

(2)可执行文件：适用于约定运行环境的软件安装包或部署包。

(3)文档：包括但不限于《用户手册》、《管理员手册》、《系统部署与配置指南》、《测试报告》。

(4)授权：软件使用许可证（如适用）。

第四部分：开发计划与时间表

1.项目周期：本项目预计总开发周期为[具体月份或天数，例如：12个月]，自合同生效且甲方提供完整需求文档之日起计算。

2.项目阶段：

(1)需求分析与确认阶段（[起始日期]至[结束日期]）：乙方进行需求调研，输出需求规格说明书，经甲方确认。

(2)系统设计阶段（[起始日期]至[结束日期]）：完成软件架构设计、数据库设计、接口设计等，提交设计文档供甲方评审。

(3)编码实现阶段（[起始日期]至[结束日期]）：根据设计文档进行软件编码开发，乙方每[具体周期，例如：2周]提交一次阶段性开发成果供甲方审阅。

(4)测试阶段（[起始日期]至[结束日期]）：进行单元测试、集成测试和系统测试，提交测试报告。

(5)部署与验收阶段（[起始日期]至[结束日期]）：在甲方指定环境部署软件，进行用户验收测试（UAT），直至甲方签署验收确认书。

3.里程碑：项目关键节点及验收标准如下：

(1)需求规格说明书确认：甲方在收到乙方提交的需求文档后[具体天数，例如：5个工作日]内完成确认。

(2)系统设