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2025年单细胞空间转录组(Stereo-seq)数据处理考核试卷
一、单项选择题(每题1分,共30题)
1.Stereo-seq数据处理的首要步骤是?
A.数据质量控制
B.降维分析
C.预测基因表达
D.空间转录组构建
2.在Stereo-seq数据质量控制中,通常需要剔除的读数比例是?
A.10%
B.20%
C.30%
D.40%
3.Stereo-seq数据降维分析常用的方法不包括?
A.PCA
B.t-SNE
C.UMAP
D.K-means
4.Stereo-seq中,空间聚类分析常用的算法是?
A.DBSCAN
B.K-means
C.hierarchicalclustering
D.alloftheabove
5.Stereo-seq数据中,如何识别空间转录组中的不同细胞类型?
A.基于基因表达差异
B.基于空间位置信息
C.A和B
D.A或B
6.Stereo-seq数据分析中,常用的可视化工具是?
A.Seurat
B.Scanpy
C.BothAandB
D.Noneoftheabove
7.Stereo-seq数据中,如何评估细胞类型的空间分布?
A.通过热图分析
B.通过空间聚类结果
C.A和B
D.A或B
8.Stereo-seq数据分析中,常用的差异基因表达分析方法不包括?
A.DESeq2
B.edgeR
C.limma
D.alloftheabove
9.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的共表达分析?
A.通过WGCNA
B.通过PCC分析
C.A和B
D.A或B
10.Stereo-seq数据中,如何进行空间转录组的时空变化分析?
A.通过时间序列分析
B.通过空间自相关分析
C.A和B
D.A或B
11.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相互作用分析?
A.通过细胞类型网络分析
B.通过空间共定位分析
C.A和B
D.A或B
12.Stereo-seq数据分析中,常用的统计检验方法不包括?
A.t-test
B.ANOVA
C.Chi-squaretest
D.Mann-WhitneyUtest
13.Stereo-seq数据中,如何进行基因表达调控分析?
A.通过ChIP-seq数据整合
B.通过RNA-seq数据整合
C.A和B
D.A或B
14.Stereo-seq数据中,如何进行细胞命运决定分析?
A.通过单细胞轨迹推断
B.通过空间转录组动态分析
C.A和B
D.A或B
15.Stereo-seq数据分析中,常用的机器学习方法不包括?
A.SVM
B.RandomForest
C.NeuralNetworks
D.K-means
16.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型识别的可靠性评估?
A.通过交叉验证
B.通过外部数据验证
C.A和B
D.A或B
17.Stereo-seq数据中,如何进行空间转录组的分辨率优化?
A.通过调整采样密度
B.通过优化算法参数
C.A和B
D.A或B
18.Stereo-seq数据分析中,常用的生物学数据库不包括?
A.GeneOntology
B.KEGG
C.UniProt
D.PDB
19.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的功能富集分析?
A.通过GOanalysis
B.通过KEGGanalysis
C.A和B
D.A或B
20.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的通路分析?
A.通过KEGGanalysis
B.通过Reactomeanalysis
C.A和B
D.A或B
21.Stereo-seq数据分析中,常用的聚类方法不包括?
A.hierarchicalclustering
B.K-means
C.DBSCAN
D.GaussianMixtureModel
22.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相关性分析?
A.通过Pearsoncorrelation
B.通过Spearmancorrelation
C.A和B
D.A或B
23.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的距离计算?
A.通过欧氏距离
B.通过曼哈顿距离
C.A和B
D.A或B
24.Stereo-seq数据分析中,常用的降维方法不包括?
A.PCA
B.t-SNE
C.UMAP
D.LDA
25.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的共表达网络构建?
A.通过WGCNA
B.通过PCC分析
C.A和B
D.A或B
26.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相互作用网络构建?
A.通过细胞类型网络分析
B.通过空间共定位分析
C.A和B
D.A或B
27.Stereo-seq数据分析中,常用的可视化工具不包括?
A.Seurat
B.Scanpy
C.Cy
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