2025年单细胞空间转录组(Stereo-seq)数据处理考核试卷.docVIP

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2025年单细胞空间转录组(Stereo-seq)数据处理考核试卷

一、单项选择题(每题1分,共30题)

1.Stereo-seq数据处理的首要步骤是?

A.数据质量控制

B.降维分析

C.预测基因表达

D.空间转录组构建

2.在Stereo-seq数据质量控制中,通常需要剔除的读数比例是?

A.10%

B.20%

C.30%

D.40%

3.Stereo-seq数据降维分析常用的方法不包括?

A.PCA

B.t-SNE

C.UMAP

D.K-means

4.Stereo-seq中,空间聚类分析常用的算法是?

A.DBSCAN

B.K-means

C.hierarchicalclustering

D.alloftheabove

5.Stereo-seq数据中,如何识别空间转录组中的不同细胞类型?

A.基于基因表达差异

B.基于空间位置信息

C.A和B

D.A或B

6.Stereo-seq数据分析中,常用的可视化工具是?

A.Seurat

B.Scanpy

C.BothAandB

D.Noneoftheabove

7.Stereo-seq数据中,如何评估细胞类型的空间分布?

A.通过热图分析

B.通过空间聚类结果

C.A和B

D.A或B

8.Stereo-seq数据分析中,常用的差异基因表达分析方法不包括?

A.DESeq2

B.edgeR

C.limma

D.alloftheabove

9.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的共表达分析?

A.通过WGCNA

B.通过PCC分析

C.A和B

D.A或B

10.Stereo-seq数据中,如何进行空间转录组的时空变化分析?

A.通过时间序列分析

B.通过空间自相关分析

C.A和B

D.A或B

11.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相互作用分析?

A.通过细胞类型网络分析

B.通过空间共定位分析

C.A和B

D.A或B

12.Stereo-seq数据分析中,常用的统计检验方法不包括?

A.t-test

B.ANOVA

C.Chi-squaretest

D.Mann-WhitneyUtest

13.Stereo-seq数据中,如何进行基因表达调控分析?

A.通过ChIP-seq数据整合

B.通过RNA-seq数据整合

C.A和B

D.A或B

14.Stereo-seq数据中,如何进行细胞命运决定分析?

A.通过单细胞轨迹推断

B.通过空间转录组动态分析

C.A和B

D.A或B

15.Stereo-seq数据分析中,常用的机器学习方法不包括?

A.SVM

B.RandomForest

C.NeuralNetworks

D.K-means

16.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型识别的可靠性评估?

A.通过交叉验证

B.通过外部数据验证

C.A和B

D.A或B

17.Stereo-seq数据中,如何进行空间转录组的分辨率优化?

A.通过调整采样密度

B.通过优化算法参数

C.A和B

D.A或B

18.Stereo-seq数据分析中,常用的生物学数据库不包括?

A.GeneOntology

B.KEGG

C.UniProt

D.PDB

19.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的功能富集分析?

A.通过GOanalysis

B.通过KEGGanalysis

C.A和B

D.A或B

20.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的通路分析?

A.通过KEGGanalysis

B.通过Reactomeanalysis

C.A和B

D.A或B

21.Stereo-seq数据分析中,常用的聚类方法不包括?

A.hierarchicalclustering

B.K-means

C.DBSCAN

D.GaussianMixtureModel

22.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相关性分析?

A.通过Pearsoncorrelation

B.通过Spearmancorrelation

C.A和B

D.A或B

23.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的距离计算?

A.通过欧氏距离

B.通过曼哈顿距离

C.A和B

D.A或B

24.Stereo-seq数据分析中,常用的降维方法不包括?

A.PCA

B.t-SNE

C.UMAP

D.LDA

25.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的共表达网络构建?

A.通过WGCNA

B.通过PCC分析

C.A和B

D.A或B

26.Stereo-seq数据中,如何进行细胞类型间的相互作用网络构建?

A.通过细胞类型网络分析

B.通过空间共定位分析

C.A和B

D.A或B

27.Stereo-seq数据分析中,常用的可视化工具不包括?

A.Seurat

B.Scanpy

C.Cy

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