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2025年单细胞轨迹分析(Monocle3)与发育Lineage构建考核试卷
一、单项选择题(每题1分,共30题)
1.Monocle3软件主要用于分析哪种类型的数据?
A.测序数据
B.表观遗传数据
C.单细胞轨迹数据
D.结构数据
2.在Monocle3中,用于对单细胞数据进行降维的主要方法是什么?
A.PCA
B.t-SNE
C.UMAP
D.K-means
3.单细胞轨迹分析的主要目的是什么?
A.确定细胞类型
B.分析细胞分化路径
C.检测基因表达模式
D.研究基因组结构
4.Monocle3中,用于构建单细胞轨迹的主要算法是什么?
A.PAM
B.Trajectory
C.Scanpy
D.Seurat
5.在单细胞轨迹分析中,pseudo-time指的是什么?
A.细胞的年龄
B.细胞的分化时间
C.细胞的活跃度
D.细胞的变异度
6.Monocle3中,如何进行细胞轨迹的可视化?
A.t-SNE图
B.UMAP图
C.PCA图
D.轨迹图
7.在单细胞轨迹分析中,cellstates指的是什么?
A.细胞类型
B.细胞状态
C.细胞分化路径
D.细胞变异
8.Monocle3中,如何进行基因表达分析?
A.DESeq2
B.EdgeR
C.Scanpy
D.Seurat
9.单细胞轨迹分析中,differentiationtrajectory指的是什么?
A.细胞分化路径
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
10.Monocle3中,如何进行细胞聚类?
A.K-means
B.hierarchicalclustering
C.DBSCAN
D.GaussianMixtureModel
11.在单细胞轨迹分析中,celllineage指的是什么?
A.细胞谱系
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
12.Monocle3中,如何进行细胞轨迹的构建?
A.Trajectoryinference
B.K-means
C.hierarchicalclustering
D.PCA
13.在单细胞轨迹分析中,geneexpression指的是什么?
A.基因表达模式
B.基因变异
C.基因调控
D.基因结构
14.Monocle3中,如何进行基因表达的可视化?
A.Heatmap
B.PCA图
C.t-SNE图
D.轨迹图
15.在单细胞轨迹分析中,celldifferentiation指的是什么?
A.细胞分化
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
16.Monocle3中,如何进行细胞分化的分析?
A.DESeq2
B.EdgeR
C.Scanpy
D.Seurat
17.在单细胞轨迹分析中,cellstatetransition指的是什么?
A.细胞状态转换
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
18.Monocle3中,如何进行细胞状态转换的分析?
A.Trajectoryinference
B.K-means
C.hierarchicalclustering
D.PCA
19.在单细胞轨迹分析中,generegulatorynetwork指的是什么?
A.基因调控网络
B.基因表达模式
C.基因变异
D.基因结构
20.Monocle3中,如何进行基因调控网络的分析?
A.WGCNA
B.PAM
C.Scanpy
D.Seurat
21.在单细胞轨迹分析中,scRNA-seq指的是什么?
A.单细胞RNA测序
B.基因芯片
C.测序数据
D.表观遗传数据
22.Monocle3中,如何进行单细胞RNA测序数据的分析?
A.DESeq2
B.EdgeR
C.Scanpy
D.Seurat
23.在单细胞轨迹分析中,celltypeidentification指的是什么?
A.细胞类型鉴定
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
24.Monocle3中,如何进行细胞类型鉴定的分析?
A.K-means
B.hierarchicalclustering
C.DBSCAN
D.GaussianMixtureModel
25.在单细胞轨迹分析中,developmentaltrajectory指的是什么?
A.发育轨迹
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
26.Monocle3中,如何进行发育轨迹的分析?
A.Trajectoryinference
B.K-means
C.hierarchicalclustering
D.PCA
27.在单细胞轨迹分析中,cellularheterogeneity指的是什么?
A.细胞异质性
B.细胞类型
C.细胞状态
D.细胞变异
28.Monocle3中,如何进行细胞异质性的分析?
A.t-SNE图
B.UMAP图
C.PCA图
D.轨迹图
29.在单细胞轨迹
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