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2025年单细胞空间转录组数据批次效应校正考核试卷
一、单项选择题（每题1分，共30题）
1.单细胞空间转录组数据批次效应校正的主要目的是什么？
A.提高数据量
B.降低测序错误率
C.消除不同批次间的系统性差异
D.增加细胞类型数量
2.以下哪种方法不属于批次效应校正方法？
A.Combat
B.Seurat
C.Harmony
D.Limma
3.在单细胞空间转录组数据中，批次效应通常来源于哪里？
A.细胞捕获过程
B.实验操作差异
C.数据分析方法
D.所有以上选项
4.Combat方法主要用于校正哪种类型的批次效应？
A.表达量批次效应
B.可重复性批次效应
C.细胞类型批次效应
D.数据缺失批次效应
5.Seurat软件包中的哪个函数可以用于批次效应校正？
A.`NormalizeData`
B.`FindVariableFeatures`
C.`BatchCorrect`
D.`ClusterCells`
6.Harmony方法的主要优势是什么？
A.计算速度更快
B.校正效果更好
C.对数据量要求更低
D.操作更简单
7.在进行批次效应校正前，需要对数据进行什么预处理？
A.对数转换
B.缺失值填充
C.归一化处理
D.所有以上选项
8.以下哪种指标可以用来评估批次效应校正的效果？
A.可重复性系数
B.均方误差
C.皮尔逊相关系数
D.所有以上选项
9.单细胞空间转录组数据批次效应校正的难点是什么？
A.数据量庞大
B.细胞异质性高
C.批次效应复杂多样
D.所有以上选项
10.在使用Seurat进行批次效应校正时，需要设置哪个参数？
A.`scale.factor`
B.`batch`
C.`n.pca`
D.`min.feature`
11.Combat方法的核心思想是什么？
A.通过线性模型消除批次效应
B.基于距离度量校正批次效应
C.使用非负矩阵分解校正批次效应
D.通过聚类分析校正批次效应
12.Harmony方法的主要原理是什么？
A.基于主成分分析校正批次效应
B.通过图论方法校正批次效应
C.使用非线性优化算法校正批次效应
D.通过多重线性回归校正批次效应
13.在进行批次效应校正时，如何选择合适的校正方法？
A.根据数据特点选择
B.参考文献和文献综述
C.尝试多种方法比较效果
D.所有以上选项
14.批次效应校正后，如何评估校正效果？
A.可视化分析
B.统计检验
C.功能富集分析
D.所有以上选项
15.单细胞空间转录组数据批次效应校正的常见挑战是什么？
A.数据量大
B.细胞异质性
C.批次差异复杂
D.所有以上选项
16.Combat方法的主要适用场景是什么？
A.微阵列数据
B.单细胞RNA测序数据
C.表观遗传学数据
D.蛋白质组学数据
17.Seurat软件包中的哪个函数可以用于可视化批次效应校正前后的数据？
A.`DimPlot`
B.`FeaturePlot`
C.`t-SNE`
D.`UMAP`
18.Harmony方法的主要应用领域是什么？
A.单细胞RNA测序
B.表观遗传学
C.蛋白质组学
D.转基因研究
19.在进行批次效应校正时，如何处理数据缺失问题？
A.使用插值方法填充
B.删除缺失值较多的样本
C.使用多重插补方法
D.所有以上选项
20.批次效应校正后的数据如何用于下游分析？
A.聚类分析
B.差异表达分析
C.功能富集分析
D.所有以上选项
21.单细胞空间转录组数据批次效应校正的常用工具有哪些？
A.Seurat
B.Scanpy
C.Harmony
D.所有以上选项
22.Combat方法的主要参数有哪些？
A.`target`
B.`block`
C.`ratio`
D.所有以上选项
23.Seurat软件包中的哪个函数可以用于识别批次效应？
A.`FindAssay`
B.`IdentifyBatchEffect`
C.`PCA`
D.`ClusterCells`
24.Harmony方法的主要计算步骤是什么？
A.主成分分析
B.聚类分析
C.非线性优化
D.所有以上选项
25.在进行批次效应校正时，如何选择合适的批次变量？
A.根据实验设计选择
B.参考文献和文献综述
C.统计分析
D.所有以上选项
26.批次效应校正后的数据如何用于细胞类型鉴定？
A.聚类分析
B.可视化分析
C.功能富集分析
D.所有以上选项
27.Combat方法的主要局限是什么？
A.计算复杂度高
B.对数据量要求高
C.校正效果有限
D.所有以上选项
28.Seurat软件包的主要优势是什么？
A.功能丰富
B.操作简单
C.计算速度快
D.所有以上选项
29.Harmony方法的主要计算复杂度是什么？
A.高
B.中
C.低
D.不确定
30.在进行批次效应校正
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