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3)分子中多肽主链由长短不等的8段直的α-螺旋组成,分子中几乎80%氨基酸处于α-螺旋区内,8段螺旋分别命名为A,B,C……H;非螺旋区肽段为NA,AB,……,HC。4)8个螺旋段大体上组装成两层,构成肌红蛋白的单结构域。*第二章脂类化学第62页,共96页。*第二章脂类化学第63页,共96页。5)肌红蛋白的整个分子呈十分致密结实的球形,分子内部只有1个能容纳4个水分子的空间。6)亲水性侧链的氨基酸残基几乎全部分布在分子的外表面,疏水侧链的氨基酸残基几乎全部被埋在分子内部。*第二章脂类化学第64页,共96页。*第二章脂类化学第65页,共96页。3.3辅基血红素的结构*第二章脂类化学第66页,共96页。*第二章脂类化学第67页,共96页。*第二章脂类化学第68页,共96页。3.4无规卷曲(randomcoil)泛指那些不能被归入明确的二级结构如折叠或螺旋的肽区段,是一种无确定规律的松散肽链结构,。这类有序的非重复性结构常构成酶的活性中心和其他蛋白质特异的功能部位.*第二章脂类化学第30页,共96页。*第二章脂类化学第31页,共96页。4、纤维状蛋白质4.1α-角蛋白及β-角蛋白P212-2154.2胶原蛋白P215-2184.3肌球蛋白、肌动蛋白和原肌球蛋白4.4肌纤维结构P280*第二章脂类化学第32页,共96页。*第二章脂类化学第33页,共96页。*第二章脂类化学第34页,共96页。*第二章脂类化学第35页,共96页。4.2胶原蛋白*第二章脂类化学第36页,共96页。4.3肌球蛋白的分子结构*第二章脂类化学第37页,共96页。肌动蛋白和原肌球蛋白*第二章脂类化学第38页,共96页。粗丝与细丝*第二章脂类化学第39页,共96页。*第二章脂类化学第40页,共96页。Ⅱ超二级结构和结构域
1超二级结构(super-secondarystructure)1.1含义P220超二级结构是由若干相邻的二级结构元件(主要是α-螺旋和β-折叠)组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的、有规则的二级结构聚合体它是蛋白质构象中二级和三级结构之间的一个层次,故称超二级结构。1.2三种基本组合形式:αα;βαβ;ββ*第二章脂类化学第41页,共96页。*第二章脂类化学第42页,共96页。*第二章脂类化学第43页,共96页。2结构域(structuraldomain,domain)2.1概念多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密实体,称为结构域(structuraldomain,domain)或域.单结构域蛋白如核糖核酸酶,肌红蛋白等.多结构域蛋白*第二章脂类化学第44页,共96页。2.2结构域的类型根据所含的二级结构种类和组合方式分为:反平行α-螺旋式(全α-结构)平行或混合型β-折叠片式(α,β结构)反平行β-折叠片式(全β-结构)富含金属或二硫键式(不规则小蛋白结构)*第二章脂类化学第45页,共96页。*第二章脂类化学第46页,共96页。*第二章脂类化学第47页,共96页。几种常见的结构域*第二章脂类化学第48页,共96页。Ⅲ蛋白质的三级结构1、概念2、三级结构与一级结构的关系一级结构决定(三级)高级结构2.1核糖核酸酶的一级结构2.2核糖核酸酶的变性与复性3、三级结构的举例—肌红蛋白(myoblobin,Mb)*第二章脂类化学第49页,共96页。1、蛋白质的三级结构概念
指蛋白质多肽链上所有原子在三维空间的分布。蛋白质的多肽链在二级结构的基础上,由于其顺序上相隔较远的AA残基侧链相互作用,再进一步的盘曲、折叠形成具有一定规律的空间结构。具有三级结构的蛋白质可以有生物学的活性。小蛋白质分子:多为单结构域,即三级结构;大蛋白质分子:由2或2个以上结构域结合成三级结构。*第二章脂类化学第50页,共96页。2.1核糖核酸酶的一级结构*第二章脂类化学第51页,共96页。催化RNA水解的酶,由124个氨基酸残基组成的单链,含有8个半胱氨酸组成的4个二硫键,26-84,40-95,58-110,65-72,数字是从N-末端编号*第二章脂类化学第52页,共96页。2.2核糖核酸酶的变性与复性:1/7×1/5×1/3=1/105*第二章脂类化学第53页,共96页。用尿素(或盐酸胍)和β-巯基乙醇处理
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