DB21T 2325-2014 猪传染性胃肠炎病毒RT-PCR检测方法.docxVIP

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ICS11.220B41

DB21

辽宁省地方标准

DB21/T2325—2014

猪传染性胃肠炎病毒RT-PCR检测方法

MethodofRT-PCRforthedetectionoftransmissiblegastroenteritisvirus

2014-07-05发布2014-09-05实施

辽宁省质量技术监督局发布

I

DB21/T2325—2014

前言

本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。

本标准由辽宁省动物疫病预防控制中心提出。

本标准由辽宁省畜牧兽医局归口。

本标准起草单位:辽宁省动物疫病预防控制中心、辽宁省动物医学研究院。

本标准主要起草人:于学武、谷志大、赵晓彤、陈瑶、赵凤菊、赵培、闫明媚、兰德松、关乃鹏、关淼、孙世宇、华泽军、刁贺军、王志国

DB21/T2325—2014

1

猪传染性胃肠炎病毒RT-PCR检测方法

1范围

本标准规定了猪传染性胃肠炎病毒(transmissiblegastroenteritisvirus,TGEV)RT-PCR检测方法的技术要求。

本标准适用于猪传染性胃肠炎的诊断和监测,适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中TGEV核酸的检测。

本标准中的试验操作应在生物安全Ⅱ级(BSL-2)以上的实验室进行。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

兽医实验室生物安全技术管理规范

3缩略语

下列缩略语适用于本标准。

TGEV:猪传染性胃肠炎病毒(transmissiblegastroenteritisvirus)

DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)

RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)

DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)

bp:碱基对(basepair)

RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscriptionpolymerasechainreaction)

Taq酶:HSTaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)

dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)

AMV:鸟类成髓细胞白血病病毒(avianmyeloblastosisvirus)

PBS:磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution)

TAE:Tris-乙酸电泳缓冲液(trisacetate-EDTAbuffer)

4原理

TGEV是一种RNA病毒。RNA反转录产生的cDNA可作为PCR模板进行扩增。根据PEDV保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。

5仪器和器材

DB21/T2325—2014

2

本技术规范中需使用的主要仪器和器材有高速台式冷冻离心机(最大离心力12000g以上)、冰箱(2~8℃,-20℃和-70℃三种)、PCR扩增仪、电泳仪、凝胶成像系统、微波炉、分析天平、1.5mL离心管、0.2mL离心管、微量移液器和吸头。

6试剂和材料

6.1Trizol:RNA抽提试剂,外观为粉红色,分装至棕色瓶中,于4~8℃保存。

6.2氯仿:4℃预冷。

6.3异丙醇:4℃预冷。

6.475%乙醇:用新开启的无水乙醇和DEPC水配制,-20℃预冷。

6.5DEPC水:去离子水中加入0.1%DEPC,37℃作用1h,121(±2)℃,高压灭菌15min。

6.6RNA酶抑制剂(40U/μL)。

6.7DNA聚合酶:HSTaqDNA聚合酶(5U/μL)。

6.8dNTP(10mmol/L)。

6.9用于RT-PCR反应的引物浓度为20μmol/L,其序列如下:

上游引物F:5′-GTGGTCGGAAGAGTAATAACATAC-3′

下游引物R:5′-CAACCCAGACAACTCCATCTA-3′

6.10反转录酶:AMV反转录酶(5U/μL)。

6.11反转录引物:OligodT

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