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研究报告
DOI:10.13995/ki.11-1802/ts.038595
引用格式:路婧,夏雪娟,黄骏楠,等.不同富营养培养基对人肠道菌群的体外培养效果比较分析[J].食品与发酵工业,2024,50
(24):201-211.LUJing,XIAXuejuan,HUANGJunnan,etal.Comparativeanalysisofinvitrocultivationeffectsofdifferent
richmediaonhumanintestinalmicrobiota[J].FoodandFermentationIndustries,2024,50(24):201-211.
不同富营养培养基对人肠道菌群的体外培养效果比较分析
路婧,夏雪娟,黄骏楠,陈泫羽,周璐,董庆利∗
(上海理工大学健康科学与工程学院,上海,200093)
摘要以富含营养的培养基(richmedia,RM)为关键组成部分的培养组学技术的兴起为肠道菌群与宿主互作
的机制研究提供了重要保障。为了探究不同RM对人肠道菌群的体外培养效果,采用平板计数法以及16SrDNA
高通量测序技术分析YCFA培养基(yeastextract-caseinhydrolysate-fattyacidmedium)、GAM培养基(gifuanaerobic
medium)和一种具有专利保护的ZJ培养基对人肠道菌群的体外培养效果。平板计数法显示在不同培养基中培
养不同时间(0~7d)后菌落总数多呈先上升后下降的趋势,经3种培养基培养后肠道菌群的菌落总数的最高值
为:ZJ(9.88lgCFU/mL)GAM(9.79lgCFU/mL)YCFA(9.68lgCFU/mL)。高通量测序结果显示体外培养
后细菌多样性降低,各培养基会选择性富集不同菌株,其中ZJ培养基培养后群落多样性下降最为明显。β-多样
性分析结果显示GAM培养基培养后肠道菌群的组成更接近于未培养时的菌群组成。因此,与YCFA和ZJ培养
基相比,GAM培养基是一种更优的适合肠道菌群体外培养的RM培养基。
关键词肠道菌群;富营养培养基;菌落总数;多样性分析;厌氧培养
人体独特的肠道环境为微生物的生存提供了良以及向培养基中添加特定生长因子等多种培养方法,
[1]
好的栖息处所。研究表明人体肠道内微生物数量高通量地分离复杂环境样品中微生物。该方法极大
14[2][6-8]
高达10个,与胃肠道疾病密切相关,同时与心血的提升了发现新种及研究微生物互作的能力。
管系统、内分泌系统和神经系统疾病也有着密切的联虽然通过在培养基中添加微生物生长所需的底物可
[3]
系。采用基因测序方法对比疾病人群及健康人群用于富集和分离微生物,但想要在培养基中实现良好
的肠道菌群,分析菌群构成及功能差异,寻找与疾病的适合多数微生物生长的条件还非常困难。因此,富
存在密切联系的微生物,从而分析微生物参与人体代含营养的培养基在肠道菌群研究中受到广泛的关注,
[4]
谢的关键作用可为疾病的诊断和治疗提供帮助。因其有助于提高微生物的培养效率以及发现新的微
基于基因组技术的微生物组研究被《科学》杂志评为
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