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兩段以上的這種折疊成鋸齒狀的肽鏈,通過氫鍵相連而平行成片層狀的結構稱為β-折疊或稱β-片層結構。 β-折疊結構特點是: ①是肽鏈相當伸展的結構,肽平面之間折疊成鋸齒狀,相鄰肽平面間呈110°角。②依靠兩條肽鏈或一條肽鏈內的兩段肽鏈間的C=O與H形成氫鍵,使構象穩定。 ③兩段肽鏈可以是平行的,也可以是反平行的。即前者兩條鏈從“N端”到“C端”是同方向的,後者是反方向的。 β-折疊結構的形式十分多樣,正、反平行能相互交替。平行的β-折疊結構中,兩個殘基的間距為0.65nm;反平行的β-折疊結構,則間距為0.7nm。 ④氨基酸殘基的R側鏈分佈在片層的上方或下方。?-轉角
(β-turn)蛋白質分子中,肽鏈經常會出現180°的回折,在這種回折角處的構象就是β-轉角或稱β-折角(β-blend)。β-轉角中,第一個氨基酸殘基的C=O與第四個殘基的N-H形成氫鍵,從而使結構穩定。無規線團(randomcoil)又稱無規捲曲或捲曲,它泛指那些不能被歸入明確的二級結構如折疊或螺旋的多肽區段。必須指出捲曲這個術語容易引起誤解。實際上這些區段大多數既不是捲曲,也不是完全無規的。這些“無規線團”也像其他二級結構那樣是明確而穩定的結構,否則蛋白質就不可能形成三維空間上的每維都具週期性結構的晶體。但是它們受側鏈相互作用的影響很大。這類有序的非重複性結構經常構成酶活性部位和其他蛋白質特異的功能部位。*蛋白質的分子結構蛋白質是複雜的大分子,其結構複雜,具有三維空間結構。根據蛋白質肽鏈折疊的方式與複雜的程度將蛋白質的分子結構分為四級,即一級結構和空間結構(包括二,三,四級結構)。
一.蛋白質的一級結構
(primarystructure)蛋白質的一級結構又稱共價結構或者基本結構,蛋白質是由L-α氨基酸組成的高分子有機化合物(前面講過蛋白質的基本組成單位是氨基酸),不同的蛋白質的氨基酸的種類、數量和排列順序不相同,導致了蛋白質結構的複雜性和生物學功能的多樣性。正是因為氨基酸的種類、數量和排列順序不相同導致了蛋白質結構的複雜性和生物學功能的多樣性,所以蛋白質的一級結構要討論的中心問題是:1)????蛋白質分子中氨基酸之間是怎樣連接的?2)????每種蛋白質是否有確定的氨基酸排列順序?(一)、肽鏈和肽鍵
peptidechainandpeptidebond肽鍵(peptidebond)p16:是蛋白質分子中基本的化學鍵,是由一分子氨基酸的α-羧基與另一分子氨基酸的α-氨基縮合脫水而成的亞醯胺鍵。
那麼肽及肽鏈的概念又是怎麼樣的呢?肽:指氨基酸通過肽鍵相連而成的化合物。由兩個氨基酸組成的肽稱為二肽,三個氨基酸組成的肽稱為三肽。依此類推,一般地把十個氨基酸以下組成的肽稱為寡肽(oligopeptide),十個氨基酸以上組成的肽稱為多肽或者多肽鏈(polypeptide)其結構為:規則(P16底部)1)、書寫格式從N到C。2)、蛋白質和肽的命名從N到C。3)、體內多肽或蛋白質合成的過程從N到C。舉例:Ala-Gly-Ser,Ser-Gly-Ala;Gly-Ser-Ala,Ser-Ala-Gly同是三種氨基酸組成的三肽,但若排列順序不同,則組成不同的三肽。所以20種氨基酸可以構成許多種蛋白質。P171953年測定牛胰島素氨基酸的順序,第一次展示Pr是具有確切的氨基酸順序,每一種Pr具有特異而嚴格的氨基酸種類、數量和排列順序。蛋白質一級結構概念(P17):蛋白質是由不同種類,數量和排列順序的氨基酸,通過肽鍵相連而構成的高分子有機含氮化合物。蛋白質的一級結構是其作用的特異性、空間結構的差異性和生物學功能多樣性的基礎。多肽鏈的一級結構存在三種形式:分枝開鏈、無分枝開鏈和環狀多肽。二.蛋白質的構象(conformation)蛋白質的分子構象又稱空間結構、立體結構、高級結構或三維構象等。它包括二級結構,三級結構和四級結構。蛋白質分子構像是指蛋白質分子中原子和基團在三維空間上的排列分佈及肽鍵的走向。(一)、維持蛋白質構象的化學鍵蛋白質一級結構的主要化學鍵是肽鍵也有少量二硫鍵。而維持蛋白質空間結構的化學鍵主要是一些次極鍵。次極鍵雖然鍵能小,穩定性差,但由於數目眾多,因此在維持蛋白質分子的空間構象中起極為重要的作用
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