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材料力学数值方法：分子动力学(MD)：周期性边界条件下的分子动力学模拟.docx

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    材料力学数值方法：分子动力学(MD)：周期性边界条件下的分子动力学模拟

    1绪论

    1.1分子动力学模拟简介

    分子动力学（MolecularDynamics,MD）是一种计算方法，用于模拟大量粒子（如原子或分子）在给定的势能函数下随时间的运动。MD模拟基于牛顿运动定律，通过数值积分求解粒子的运动方程，从而预测粒子的轨迹和系统的行为。这种方法在材料科学、化学、生物学等领域有着广泛的应用，例如研究材料的力学性质、分子间的相互作用、蛋白质的折叠过程等。

    1.1.1牛顿运动方程的数值积分

    MD模拟的核心是求解牛顿第二定律的微分方程，即：

    m

    其中，mi是粒

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