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2009年重庆地区肠道病毒71型流行株的深度剖析：从分离鉴定到基因特征洞察

一、引言

1.1研究背景

肠道病毒71型（Enterovirus71，EV71）属于小RNA病毒科肠道病毒属，是引发婴幼儿手足口病（Hand-Foot-and-MouthDisease，HFMD）的主要病原体之一，具有感染性强、致病率高的特点。该病毒主要通过粪-口途径传播，也可经呼吸道飞沫传播以及接触患者皮肤、黏膜疱疹液而感染。在人群密集场所，尤其是幼儿园、托儿所等儿童聚集区域，传播风险较高。

感染EV71后，多数患者症状较轻，以发热和手、足、口腔等部位的皮疹或疱疹为主要表现，具有一定自限性。然而，部分患儿可能进展为重症病例，出现中枢神经系统损害，如脑膜炎、脑炎、脑脊髓炎，还可能引发肺水肿、循环障碍等严重并发症，甚至危及生命。特别是对于5岁以下儿童，由于其免疫系统尚未发育完善，对EV71的抵抗力较弱，感染后更易发展为重症，给儿童健康带来严重威胁。

自1969年EV71首次从美国加利福尼亚患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中被分离出来后，在全球范围内引发了多次爆发与流行。1975年保加利亚的大流行，共有705名患儿感染，其中149例发生急性弛缓性瘫痪，44例死亡；1997年马来西亚大流行，2628例发病，39例急性脊髓灰质炎样麻痹或无菌性脑膜炎，30多例患儿死亡，平均年龄仅1.5岁；1998年中国台湾地区EV71大爆发，共发生129106例手足口病、红斑疹、疱疹性咽峡炎，405例为严重的中枢神经系统感染，78例死亡，死亡原因主要是由中枢神经系统感染导致的肺水肿和出血（83%），91%的死亡患儿小于5岁。这些大规模的疫情，给公共卫生安全带来了巨大挑战。

在中国，自20世纪90年代后期起，EV71感染引发的手足口病在部分地区开始流行，如广东、福建、上海、重庆等地均有局部流行的报道。其中，重庆地区的手足口病疫情呈现出一定的季节性和人群分布特点。2008-2009年期间，重庆地区手足口病病例数较多，对当地儿童的健康构成了显著威胁。研究该地区的EV71流行株特征，对于深入了解病毒的传播规律、致病机制以及制定针对性的防控策略具有重要意义。

1.2研究目的与意义

本研究旨在对2009年重庆地区肠道病毒71型流行株进行分离鉴定，并深入探究其病毒基因特征，具体目的如下：首先，通过对该地区临床样本的检测与分析，分离出EV71流行株，明确其在重庆地区手足口病病例中的感染比例和分布情况，全面掌握2009年重庆地区EV71的流行态势，为后续研究提供基础数据。其次，运用现代分子生物学技术，对分离出的EV71流行株进行全基因组测序，分析其基因序列特征，包括基因变异位点、基因重组情况等，了解病毒的遗传进化规律，为研究病毒的起源、传播路径提供依据。此外，通过对病毒基因特征的研究，进一步探索病毒基因与致病性之间的关系，明确与重症病例相关的基因标记，为早期识别重症患者、优化临床治疗方案提供理论支持。

本研究具有重要的理论和实践意义。从理论层面来看，对重庆地区EV71流行株基因特征的研究，有助于丰富肠道病毒71型的遗传学信息，深入了解病毒的进化机制和分子流行病学特点，完善病毒学理论体系。在实践方面，明确该地区EV71的流行特征和病毒基因特性，能够为手足口病的防控策略制定提供科学依据。通过对病毒传播规律和致病机制的掌握，公共卫生部门可以制定更加精准的防控措施，如加强重点人群和场所的监测、开展针对性的健康教育等，有效降低疾病的传播风险，减少疫情的爆发规模，保障儿童的身体健康和生命安全。同时，研究结果也可为疫苗研发和抗病毒药物的开发提供参考，推动相关医药产业的发展，提高应对EV71感染的能力。

1.3国内外研究现状

自1969年EV71被首次分离鉴定以来，国内外学者对其展开了广泛而深入的研究。在病毒的基础特性研究方面，国外早期的研究明确了EV71属于小RNA病毒科肠道病毒属，对其病毒颗粒的形态结构、理化性质等进行了详细描述，发现其病毒粒子呈二十面体对称结构，无包膜，基因组为单股正链RNA。同时，国外研究率先揭示了EV71主要通过粪-口途径传播，也可经呼吸道飞沫及接触传播的传播机制，为后续防控策略的制定提供了关键依据。

在病毒的分子生物学研究领域，国外学者通过对不同地区EV71流行株的基因测序与分析，构建了较为完善的病毒基因进化树，确定了EV71的主要基因型别，包括A、B、C三个基因型，其中B、C基因型又进一步分为多个亚型，并深入研究了不同基因型别之间的遗传差异和进化关系。在病毒的致病机制