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8.1真核生物RNAPⅡ转录的调控及mRNA的加工
真核生物的转录调控
三个步骤:起始、延伸及终止
真核生物的转录调控因素
核小体结构对基因转录的影响
由核心组蛋白(H2A,H2B,H3,H4)与DNA构成核小体结构时,即能起到抑制基因转录的作用(4倍)
添加组蛋白H1进一步抑制基因转录(25-100倍);
表观遗传学调控基因的转录活性
RNA聚合酶Ⅱ介导的转录及其调控
顺式作用元件
ClassⅡ启动子、增强子、沉默子、绝缘子
启动子(有位置依赖性)
位于转录起始位点附近,通过募集RNAP和转录因子,调控基因转录启动的DNA序列
近端启动子元件(Proximalpromoterelement)
核心启动子
TFⅡB识别元件(TFⅡB-recognitionelement,BRE)
TATAbox
起始子(Initiator,Inr)
下游核心元件(Downstreamcoreelement,DCE):3subelements(SI:+6to+12,SⅡ:+17to+23,SⅢ:+31to+33)
Motiftenelement(MTE):+18to+27
下游启动子元件(Downstreampromoterelement,DPE)
近端启动子元件和核心启动子共同募集RNAPⅡ以及通用转录因子。
其中,以核心启动子为主,近端启动子元件起辅助作用
近端启动子元件
功能:调节转录活性,缺失会导致转录活性下降
GCbox:富含G和C,如GGGCGG(-47~-61区)和CCGCCC(-80~-105区),可有2个或更多的拷贝,由转录因子Sp1识别
CCAATbox:共同序列为CCAAT,由转录因子CCAAT结合蛋白(CTF)识别
共同序列是指位于位于非模板链上的序列
Note:GCbox与CCAATbox介于启动子与增强子之间,它们没有方向依赖性(类似增强子),但具有位置依赖性(类似启动子)
核心启动子
TFⅡB识别元件(BRE)
位于TATAbox上游,保守序列为SSRCGCC(位于非模板链)(S=G/C,R=A/G)
TATAbox
位于转录起始位点上游约25-30bp(在酵母中可达30~300bp),共同序列为TATAWAAR(位于非模板链)。(R=A/G,W=A/T)
被TFⅡD复合物的TBP(TATA-boxbindingprotein)亚基识别
功能
a.确定转录起始位点(TATA区下游25-30bp左右)
b.决定启动子是否有活性
有些基因的TATAbox序列中会出现C,如HBB基因(CATA)
高效特异表达的基因通常含有TATAbox
有两类基因甚至缺乏TATAbox:
看家基因(housekeepinggene)
发育调节基因(homeoticgene)
起始子(Inr)
转录起始位点前后的保守序列,共同序列为:YYANWYY(位于非模板链),可以确定转录起始位点,其中A为转录起始位点(Y=C/T,W=T/A)
被TFⅡD复合物的TAF1和TAF2以及其他亚基识别
下游核心元件(DCE)
位于Inr元件下游
共同序列为:CTTC(SI)...CTGT(SⅡ)...AGC(SⅢ)
被TFⅡD复合物识别,参与转录调控
通常一个启动子中仅会含有3个亚元件中的1-2个,少数含有全部3个亚元件
MTE(Motiftenelements)
位于DPE上游,保守序列为CSARCSSAACGS(位于非模板链)
被TFⅡD复合物识别,与Inr元件协同募集TFⅡD复合物,在无TATAbox和DPE的情况下也能与Inr一起起始转录
下游元件(DPE,downstreampromoterelement)
共同序列为:RGWYV(R=A/G,W=A/T,Y=C/T,V=A/C/G)
被TFⅡD复合物的TAF6和TAF9亚基识别,与Inr元件协同募集TFⅡD
每个基因的启动子都是不一样的。在大多数启动子中,至少会缺失其中一个元件。如缺少TATAbox的启动子通常含有DPE
增强子(Enhancer)(无方向位置依赖性)
真核生物中能够促进或提高基因转录水平的DNA元件
位置:基因上下游1000kb以内,甚至在基因内部。
功能:转录激活因子(Activator,如CREB,Myc,NF-kB,Fos,Oct-1等)结合增强子,并募集通用转录因子、转录辅因子、RNAPⅡ等,从而促进转录。
沉默子(Silencer)无方向和位置依赖性
真核生物中能够抑制或降低基因转录水平的元件
位置:基因上下游1000kb以
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