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蛋白质组学
(Proteomics);;蛋白质组(Proteome)源于蛋白质(protein)与?基因组(genome)组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。
蛋白质组学(proteomics)指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
;蛋白质组学概念;为什么要研究蛋白组学?;蛋白质组学研究目标;蛋白质组学产生和发展;2D电泳图谱;人类蛋白质组计划
(humanproteomicsplan,HPP);蛋白质组学的研究范畴;表达蛋白质组;肝蛋白质组学研究;表达蛋白组研究成果;血浆蛋白质组学研究;修饰蛋白质组;磷酸化修饰组学;例如:天冬氨酸特异的胱天蛋白酶
是细胞凋亡的重要调节因子,蛋白质的磷酸化在其中发挥重要的作用。研究人员鉴定到500个以上凋亡特异的磷酸化位点,并证明他们在caspase切割的靶蛋白中明显富集,在切割位点成簇分布。;例如:用抗酪氨酸磷酸化抗体及多肽免疫沉淀技术对酪氨酸去磷酸化酶PTPN12的抑癌作用研究。
发现在PTPN12表达受到抑制时,乳腺癌的促癌基因EGFR受体家族的酪氨酸磷酸化显著增强,从而产生促细胞癌变的效应。
乳腺癌临床病理标本显示PTPN12蛋白表达低下。所以PTPN12可能是乳腺癌预防和治疗的新型药物靶点。;乙酰化修饰组学;以往认为乙酰化修饰主要发生在核内,乙酰基通过中和赖氨酸残基所带正电荷而改变修饰位点的理化状态,进一步改变染色质或转录因子的活性,调节基因转录或性。
研究表明赖氨酸乙酰化修饰调控代谢通路是一个从原核生物到真核生物进化上高度保守的翻译后调控机制。;相互作用蛋白质组;酵母双杂交技术
标签融合蛋白
免疫共沉淀
荧光共振能量转移技术
表面等离子共振技术
原子力显微镜技术;蛋白质相互作用研究数据平台
微生物蛋白质相互作用数据库-MPIDB,191物种,22530个蛋白质相互作用数据(/mpidb/)
哺乳动物蛋白质相互作用数据库-MIP,10个物种,900个蛋白质相互作用数据(http://mips.gsf.de/proj/ppi/);亚细胞蛋白组;细胞器蛋白表达的差异
质膜重要的靶标/功能蛋白的筛选
线粒体蛋白质组成的差异
内质网蛋白质合成和折叠的场所,在高尔基复合体协同下,参与分泌蛋白的加工分选。
细胞核基因转录调控与核孔蛋白复合体蛋白
;定量蛋白质组;蛋白质组与基因组;与生理病理过程直接相关:蛋白质是生命活动的主要执行体
复杂性:人类基因组3万个基因,蛋白质却10几万或者更多
动态性:蛋白质组的时空特异性
技术难度大:蛋白组学不像基因组可以通过PCR、基因工程、DNA测序进行研究。蛋白质扩增和定点切割,全长测序很难实现。;蛋白质组鉴定结果可以反过来对基因组注释起到修正和补充作用,甚至发现新基因。
基因组学与蛋白质组学整合分析及其在进化生物学研究中的应用,大大促进了进化生物学理论的突破。;蛋白质组学在医学研究中的应用;国际蛋白质组计划;人类蛋白质组计划进展;蛋白质组学是研究疾病标志物的重要手段;生物标志物的研究策略;生物标志物的研究策略;疾病标志物发现阶段的蛋白质组学研究方法;生物学材料;生物学材料;生物学材料;生物学材料;分离、鉴定和定量技术;疾病标志物确证阶段的蛋白质组学研究方法;在疾病标志物发现阶段,更加关注疾病早期或临床前期的变化,蛋白质变化更适用于早期诊断。
标志物的组合是提高诊断灵敏度和特异性的方法。
针对个体的高通量蛋白质组全谱测定的个体化诊断与治疗将成为发展趋势。
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