济南大学生物技术专业蛋白质组学课程2024版教学大纲.docxVIP

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济南大学生物技术专业课程教学大纲

蛋白质组学

一、课程基本信息

课程名称

蛋白质组学/Proteomics

课程类别

专业拓展课程

课程编码

19A00077

学分

1.5

学时

总学时：24

理论：24实践：0

课程负责人

王龙欣

适用专业

生物技术专业

先修课程

后续课程

二、课程简介

随着人类基因测序的基本完成，人类基因组计划开始进入后基因组时代。蛋白质组学是二十世纪九十年代中期诞生的一门新兴学科，已成为功能基因组学的重要研究领域，是当今生命科学研究的热点与前沿领域。本课程主要从蛋白质组与蛋白质组学的基本概念入手，重点介绍这一崭新领域的诞生与发展，并以具体的研究成果，详细介绍蛋白质组学研究的基本原理，研究方法及应用进展。

三、课程目标及其与毕业要求指标点的对应关系

课程目标

毕业要求

毕业要求指标点

目标1：掌握蛋白质的结构、功能基因组和蛋白质组研究的方法、分析、检测鉴定技术。

掌握生物技术基础理论、基本知识和基本技能，受到较扎实的专业理论和专业技能训练。

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目标2：学会使用常用的生物信息学工具及蛋白组学的应用

具有综合运用所掌握的理论知识和技能，从事生物技术及其相关领域产品研发的能力、具有生物技术下游工程实践和技术革新的基本能力。

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四、教学安排

第一章：从基因组学到蛋白质组学（支撑课程目标1）建议学时：2

[教学目的与要求]介绍蛋白质组学产生的背景、基本概念、基本研究方法。掌握基因组、蛋白质组研究中的基本概念、相互关系，蛋白质组学研究的内容和意义。了解蛋白质组学的特点和难点及蛋白质组学发展趋势。

[教学重点与难点]蛋白质组研究中的基本概念，蛋白质组学研究的内容和意义。

[授课方法]课堂讲授为主。

[授课内容]

引言

大规模生物学的起源

基因组、转录物组和蛋白质组

DNA和RNA水平上的功能基因组学

蛋白质组学的重要性

蛋白质组学的范畴

蛋白质组学的挑战

第二章：蛋白质分离策略（支撑课程目标1）建议学时：2

[教学目的与要求]介绍蛋白质分离的原理和基本方法；掌握蛋白质分离方法和技术，如双向凝胶电泳技术、液相色谱、多维色谱分离技术技术等。

[教学重点与难点]蛋白质分离的原理和基本方法；双向电泳技术。

[授课方法]课堂讲授为主，采用传统教学与多媒体教学相结合的方法；播放实验操作录像，辅导学生学习相关实验操作。

[授课内容]

引言

蛋白质组学中蛋白质的分离——基本原理

双向凝胶电泳的原理

蛋白质组学中的双向凝胶电泳

蛋白质组学中液相色谱的原理

多维液相色谱

第三章：蛋白质鉴定的策略（支撑课程目标1）建议学时：2

[教学目的与要求]介绍蛋白质鉴定的方法和技术；了解蛋白质鉴定的方法和技术，如免疫印迹、化学降解法测序、肽质量指纹鉴定蛋白质技术及串联质谱数据鉴定蛋白质技术。

[教学重点与难点]免疫印迹、测序和质谱的原理及方法；各鉴定技术的原理。

[授课方法]课堂讲授为主，采用传统教学与多媒体教学相结合的方法；播放实验操作录像，辅导学生学习相关实验操作。

[授课内容]

引言

利用抗体对蛋白质进行鉴定

化学降解法确定蛋白质序列

质谱在蛋白质组学中的应用——基本原理和仪器

使用质谱数据进行蛋白质鉴定

第四章：蛋白质定量方法（支撑课程目标1）建议学时：3

[教学目的与要求]蛋白质定量方法；了解蛋白质定量方法，如蛋白电泳图象分析、多重蛋白质组学及质谱技术在定量蛋白质组学中的应用。

[教学重点与难点]均为蛋白电泳图象分析。

[授课方法]多媒体教学为主。

[授课内容]

引言

用标准2D胶进行定量蛋白质组学研究

多重蛋白质组学

质谱技术应用于定量蛋白质组学

第五章：蛋白质组学与蛋白质序列分析（支撑课程目标2）建议学时：3

[教学目的与要求]介绍蛋白质序列分析方法及其重要意义。了解蛋白质序列与蛋白质功能和物进化之间的关系，蛋白质序列比对的原则和方法。

[教学重点与难点]蛋白质序列比对的基本原则。

[授课方法]课堂讲授为主，采用传统教学与多媒体教学相结合的方法。

[授课内容]

引言

蛋白质家族与进化关系

蛋白质序列比对的基本原则

寻找蛋白质远源关系

通过相似性检索进行功能注释的缺点

功能注释的其他方法

第六章：结构蛋白质组学（支撑课程目标2）建议学时：3

[教学目的与要求]介绍结构蛋白质组学的建立和研究