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#源代码#通过处理PROSITE数据资源

Peaker

PROSITE是一个描述了蛋白domain，蛋白，功能结构域以及

相关模式和蛋白谱信息的整合数据资源。主页界面如下所示

这个数据库通过PROSITE数据接口，地址为

或者是分布在单个的plaintext文本中，地

址为/

这个文件可以通过python语言中Prosite包的parse函数来进行解

析。具体用法如下

从Bio库中调用Prosite包，然后打开文件，并传递给参数handle，

通过parse进行解析，获得record记录数据，通过for循环实现一个迭

代，在每一条记录中打印出accession，name,description,pattern,created,

pdoc等信息。输出结果如下

这是第一个结果，包含6行outputresult，分别对应了accession，

name，description，pattern，created，pdoc。除此以外在迭代过程中还

输出了其他record记录，如下面两个结果

通过python语言提供的Prosite这个包可以方便快捷的通过

PROSITE数据库接口实现数据提取，分析等过程。

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