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精选2021版课件*RT-PCR原理及方法09-10-15精选2021版课件*背景基因的表达基因组DNA(genomicDNA)信使RNA(messengerRNA,mRNA)蛋白质产物不同细胞或组织表达不同的基因精选2021版课件*目的通过反转录(reversetranscription,RT)和聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)的方法,检测目的基因在特定组织或细胞中、mRNA水平的表达丰度。精选2021版课件*原理及方法mRNA(messengerRNA)cDNA(complementaryDNA)PCR产物RT(反转录)PCR(聚合酶链反应)精选2021版课件*原理及方法精选2021版课件*精选2021版课件*步骤1--提取总RNATRIzol法抽提总RNA
1、细胞1×107或组织100mg,加1mlTRIzol
(细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块匀浆要彻底,后转至EP管)
颠倒混匀10下,室温5分钟。
2、氯仿1/5体积(0.2ml),颠倒混匀10下,室温5分钟。
3、4℃,离心12000g,15分钟。
4、转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中,加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟。
5、4℃,离心12000g,10分钟。6.弃上清,加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml。
7、4℃离心7500g,5分钟。
8、弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥),溶于DEPC水中至20μl
(可在55-60℃水中,10分钟助溶)。9、紫外分光光度计测总RNA浓度。精选2021版课件*步骤2—反转录(RT)逆转录反应:1、试剂浓度体积终浓度
RNA23μl(11.5μl)
Oligo(dT)150.05μg/μl4μl(2μl)0.005μg/μl
混匀,离心,70℃5min。2、立即冰水浴,稍离心
试剂浓度体积终浓度
M-MLVBuffer5×8μl(4μl)1×
dNTP10mM2μl(1μl)0.5mM
RNasin40U/μl1μl(0.5μl)20μ
M-MLV200U/μl2μl(1μl)200U
总体积40μl(20μl)混匀,离心,42℃60-90min。3.95℃10min(破坏MLV),4℃保存。
精选2021版课件*步骤3—聚合酶链反应(PCR)PCR反应:反应体系:总体积20μl(50μl)
试剂浓度体积终浓度
TaqBuffer10×2μl(5μl_)1×
dNTP10mM0.2μl(0.5μl)200uM
上游引物10pmol/μl0.3μl(1μl)10pmol
下游引物10pmol/μl0.3μl(1μl)10pmol
cDNA模板(1-10μl)
Taq酶2.5U/μl0.3μl(1μl)2.5U/μl
DEPC水20μl-4.3μl
混匀
反应条件:95℃5分预变性
94℃30秒变性
X℃40秒退火
72℃30秒延伸
72℃7分终末延伸
28-36循环,4℃保温
精选2021版课件*步骤4—琼脂糖凝胶电泳加1-10μlPCR产物与上样缓冲液(1-2.5μl)混匀,加样,电泳。精选2021版课件*所需材料及试剂一、实验器具与材料:
1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl
2、吸头:1ml、200μl、20μl
3、匀浆管:5ml
4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个
5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl
6.试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)
1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)
7、量筒:50ml、250ml、500ml
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