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病原微生物检测在感染判定的意义

病原微生物是指可以侵犯人体，在宿主中生长繁殖、释放毒性物

质等引起机体不同程度病理变化、发生感染的微生物，包括细菌、病

毒、真菌、寄生虫、衣原体、支原体等。病原微生物检测并非新领域，

基于病原学证据的抗感染一直都是临床诊疗的金标准。如果能尽早识

别致病病原、启动恰当的抗感染方案可改善患者预后，尤其是重症感

染者。病原微生物检测在感染判定中意义重大，越来越多的检测技术

引入临床，除了传统的检测方法如涂片染色、培养分离、免疫学技术、

核酸检测等，还有新兴的二代测序技术(Next-generation

sequencing，NGS)等。虽然技术种类繁多、手段层出不穷，但对临

床医生而言，如何正确选择、利用病原微生物检测方法、正确解读检

测结果，才是临床诊治中的关键。所有对病原微生物检测结果的解读

都应基于患者、基于临床。本文的侧重点并非概述各种病原微生物检

测技术的原理及方法，而系如何利用不同的病原微生物检测技术协助

感染判定。

1不同的病原微生物检测技术在感染判定中的价值

不同病原微生物检测技术对感染的判定价值不同。临床医生应根

据患者的病情、可能感染部位、可供采集的标本等选择适宜的检测技

术。

1.1涂片(染色)技术

当前，随着病原微生物检测技术的快速发展，传统的涂片技术似

乎有被忽视的迹象。但涂片技术仍是细菌、真菌检查的最经典方法，

其操作简单、快速，有一定的诊断敏感性和特异性。这种形态学检查

对临床判定感染、快速获得病原学依据有不可替代性。通过涂片可首

先了解标本是否合格，如痰涂片。不合格的标本无须再行培养，因为

培养阳性可能误导临床。一般地，除了血液及粪便标本外，培养标本

都应做涂片镜检(血培养阳性报警后必须涂片)；如镜检直接发现细菌或

真菌菌丝、孢子，可考虑细菌、真菌感染。涂片结合染色分析更为准

确，革兰染色检测普通细菌，抗酸染色检测抗酸杆菌，弱抗酸染色检

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查奴卡菌，10%KOH和(或)乳酸棉酚兰染色检查真菌，墨汁染色检查

脑脊液中新型隐球菌，六胺银染色检查呼吸道标本中的肺孢子菌。

[1]

1.2病原培养分离

培养分离虽耗时长、检出阳性率较低、获得病因证据相对困难，

但仍是病原微生物检测的核心方法之一。其优势在于一方面培养分

[2]

离出的是活微生物，非死菌，有助于确定致病病原菌。因核酸检测等

分子生物学技术易受DNA气溶胶污染出现假阳性；菌体死亡后核酸仍

可持续残留在机体内，此时行核酸检测亦能获得阳性结果。有研究显

示，部分病原微生物感染后动态监测DNA携带时间可持续6个月以上

[3]。如果无法区分病原微生物是否具有活性，则常常会误导临床诊治。

另一方面，培养能对阳性病原微生物进行菌种鉴定和药敏试验，提供

药物敏感/耐药及最小抑菌浓度等信息，便于指导临床抗感染、避免无

效治疗。此外，培养的菌落定量都是基于活菌计数，菌落形成单位

(colony-formingunits，CFU)可计算活的菌体数量。以呼吸道标本为

例，通常认为痰培养细菌菌落计数106CFU/ml、支气管肺泡灌洗液

菌落计数10CFU/ml、经支气管镜防污染