基于杂交捕获测序的同源重组缺陷（HRD）检测技术指南.pdfVIP

基于杂交捕获测序的同源重组缺陷（HRD）检测技术指南

1范围

本文件提供了基于杂交捕获测序的同源重组缺陷（HRD）检测技术的检测通用需考虑的因素、检测

环境、试剂与仪器、样本需考虑的因素、检测流程、结果分析和性能确认方面的指导。

本文件适用于人体来源的肿瘤组织样本和或配对样本的检测，对目标基因区域杂交捕获后进行高通

量基因测序，检测同源重组缺陷分值（HRDscore）。

本文件不适用于血浆循环肿瘤DNA样本的检测；不适用于全基因组高通量测序法（WholeGenome

Sequencing,WGS）、同源重组修复（HRR）相关基因突变或甲基化水平改变检测、突变谱系特征、功能

性检测的方法检测HRD；不适用于BRCA基因失活状态的检测。对于采用非杂交捕获方法进行富集测序的

同源重组缺陷（HRD）检测技术，制造商宜依据产品的具体特性确定本技术指南中的各项内容是否适用。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，

仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其必威体育精装版版本（包括所有的修改单）适用于本

文件。

GB/T19489—2008实验室生物安全通用要求

GB/T30989—2014高通量基因测序技术规程

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

目标基因区域捕获targetregioncapture

对一个或多个基因的核苷酸序列定制目标基因区域特异性探针,与基因组DNA进行杂交,并富集目标

基因DNA片段的过程。

[来源：GB/T37872—2019，3.1.6]

杂交捕获hybridizationcapture

根据目标基因区域设计特异性探针，通过探针与待测基因组DNA进行杂交，从而特异性捕获富集的

目标基因DNA片段的过程。

同源重组缺陷homologousrecombinationdeficiency；HRD

细胞水平上的HRR功能障碍状态，可由同源重组修复相关基因胚系突变或体细胞突变以及表观遗传

失活等诸多因素导致。

注：HRD会产生特定的、可量化的、稳定的基因组改变，其中包含可被鉴别的基因突变、插入/缺失模式，以及染色

体结构异常、基因拷贝数变异等。

同源重组缺陷分值homologousrecombinationdeficiencyscore；HRDscore

基因组不稳定性分值genomicinstabilityscore；GIS

1

评估基因组同源重组缺陷水平和/或基因组疤痕特征水平的指标，由全基因组单核苷酸多态性（SNPs）

信息计算得到，可以根据不同的计算方式得到特定的、可量化的、稳定的基因组改变的分值。

4缩略语

下列缩略语适用于本文件。

BAM：二进制比对文件（binaryalignmentmap）

Bp：碱基对（basepair）

BRCA：乳腺癌易感基因（breastcancersusceptibilitygene）

CNV：拷贝数变异（copynumbervariation）

DNA：脱氧核糖核酸（deoxyribonucleicacid）

FFPE：福尔马林固定石蜡包埋（formalinfixedparaffinembedded）

GIS：基因组不稳定评分（genomicinstabilityscore）

HRD：同源重组缺陷（homologousrecombinationdeficiency）

HRR：同源重组修复（homologousrecombinationrepair）

InDel：插入缺失（insertionanddeletion）

LOH：杂合性缺失（lossofheterozygosity）

LST：大片段迁移（large-scalestatetransition）

PARP：聚腺苷二磷酸核糖聚合酶（polyADP-ribosepolymerase）

PCR：聚合酶链式反应（polymerasechainreaction）

Post-PCR：杂交后PCR（post-hyb