生物信息数据库课件.pptxVIP

生物信息数据库1、模式生物2、数据库

humanArabidopsis拟南芥ThermotogamaritimaEscherichiacoli大肠杆菌Buchnerasp.APSRickettsiaprowazekiiUreaplasmaurealyticumBacillussubtilisDrosophilamelanogasterThermoplasmaacidophilumPlasmodiumfalciparumHelicobacterpylorimouseCaenorhabitiselegansratBorreliaburgorferiBorreliaburgorferiAquifexaeolicusNeisseriameningitidisZ2491Mycobacteriumtuberculosis第一节模式生物

人类基因组，模式生物基因组计划人类基因组计划（HumanGenomeProject,HGP）1990年启动，预计2003年完成。由美、日、德、法、英、中六国参加。测出人类约3,000,000,000碱基对的序列（相当于每页3,000个字母，共需100万页印完）。中国承担其中的1%。VenterCollins

人类基因组，模式生物基因组计划模式生物基因组计划酵母、线虫、果蝇、细菌共约50多种已完成，水稻等70余种正在进行。目前总量已达60亿碱基对！

已经完成全序列测定的基因组中文名称数目备注古细菌10包括热自养甲烷菌、热球菌等真细菌42其中5个细菌各测定了多个菌株真核生物5酵母、线虫、果蝇、智人、拟南芥细胞器201质粒164?噬菌体90包括不同亚类或不同菌株类病毒36包括不同亚类或不同菌株病毒126包括不同亚类或不同菌株引自(Oct,2001)http://www.ebi.ac.uk/genomes/

virusesplasmidsbacteriafungiplantsalgaeinsectsmollusksreptilesbirdsmammalsGenomesizesinnucleotidepairs(base-pairs)10410810510610710111010109Thesizeofthehumangenomeis~3X109bp;almostallofitscomplexityisinsingle-copyDNA.Thehumangenomeisthoughttocontain~30,000to40,000genes.bonyfishamphibians

Homosapiens智人蛋白质编码基因数在2.7万至4万之间（但必威体育精装版的估计在6.5万至7.5万之间）

噬菌体（Bacteriophage）寄生于细菌内的病毒如：大肠杆菌噬菌体(coliphages)遗传物质：单链/双链、环状/线状、DNA/RNA模式生物(ModelOrganism)

模式生物(ModelOrganism)病毒（Virus）不具有细胞形态结构，仅由核酸和蛋白质构成；如：人艾滋病毒HIV、SARS冠状病毒体积小，10～300nm；严格的专性细胞内寄生；对抗生素不敏感。电子显微镜下的SARS冠状病毒100nm

Escherichiacoli

大肠杆菌大肠杆菌是研究得最为详尽的一个模式生物。这种只有1.6微米长的、可以迅速繁殖的单细胞原核生物，已经成为实验室和基因工程的重要工具。EscherichiacoliO157:H7EscherichiacoliK12模式生物(ModelOrganism)

Saccharomycescerevisiae

酿酒酵母真菌界的单细胞真核生物，有16个染色体。它的全基因组已在1996年测定。模式生物(ModelOrganism)

秀丽线虫Caenorhabditiselegans

一种透明的、生活在海滩泥沙中的小虫。细胞数目一定：成虫细胞数目只有959个，其中包括302个神经元；

有6条染色体，全基因组于1998年测定，长9.7Mb

模式生物(ModelOrganism)

Drosophilamelanogaster

果蝇繁殖很快、容易诱发变异的小昆虫。总长达1.8亿核苷酸。模式生物(ModelOrganism)

Arabidopsisthaliana

拟南芥个体生活周期只有6周的十字花科小草，是一种理想的模式植物。模式生物(ModelOrganism)

模式生物(ModelOrganism)非洲瓜蟾（Xenopuslavias