拟南芥蛋白精氨酸甲基转移酶AtPRMT5调节mRNA前体拼接的功能研究的中期报告.docxVIP

拟南芥蛋白精氨酸甲基转移酶AtPRMT5调节mRNA前体拼接的功能研究的中期报告 简介： 拟南芥（Arabidopsis thaliana）蛋白精氨酸甲基转移酶AtPRMT5是拟南芥基因组中5种蛋白精氨酸甲基转移酶之一，已知参与植物中多种生理过程的调控。本研究旨在探究AtPRMT5对mRNA前体的拼接调控作用及其机制。 研究内容： 1.构建AtPRMT5敲除拟南芥植株，通过RT-PCR和Northern blot检测AtPRMT5基因敲除后mRNA说明AtPRMT5对mRNA前体拼接有一定影响。 2.使用RNA-Seq对AtPRMT5敲除拟南芥植株和野生型拟南芥植株的转录组进行分析，发现AtPRMT5敲除影响了大量基因的表达，并且特别影响mRNA前体的拼接。 3.使用普通PCR和反转录PCR对不同拟南芥组织的mRNA前体和成熟mRNA进行检测，发现AtPRMT5调控的mRNA前体选择性剪接在不同组织中表现不同，证明该过程受到组织特异性和生物学意义的影响。 4.使用IP-MS检测AtPRMT5的交互蛋白，发现与AtPRMT5相互作用的蛋白包括调控RNA前体剪接的蛋白和其他多种转录因子。这些蛋白可能与AtPRMT5一起协同调控mRNA前体的拼接。 结论： AtPRMT5对拟南芥mRNA前体拼接有明显调节作用，且该调节作用受到组织特异性和其他转录因子的影响。AtPRMT5可能参与RNA剪接复合物的组装，并协同调控mRNA前体拼接。