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RNA生物合成采用;转录 (transcription)
生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。 ;转录与复制相同点;转录与复制不同点;第一节 原核生物转录的模板和RNA聚合酶;;模板链:反意义链(antisense strand )—— 以该链中的DNA碱基顺序指导RNA的合成即被转录的那条DNA链。;5’-----GCAGTACATGTC-----3’编码链 DNA
3’-----c g t c a t g t a c a g-----5’模板链
5’-----GCAGUACAUGUC-----3’ RNA
N ------Ala--Val--His--Val------C 蛋白质;2.不对称转录(asymmetric transcription) ;二、原核生物RNA聚合酶; ( NMP )n + NTP → ( NMP ) n+1 + PPi;全
酶
核
心
酶
;核心酶 (core enzyme);三、RNA聚合酶结合到DNA的启动子上起动转录;调控序列中的启动子是RNA聚合酶结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。原核生物以RNA聚合酶全酶结合到DNA的启动子上而起动转录,其中由σ亚基辨认启动子,其他亚基相互配合。
对启动子的研究,常采用一种巧妙的方法即RNA聚合酶保护法。;RNA聚合酶保护法;;RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合:;第19页/共79页;原核生物的转录过程;一、转录起始需要RNA聚合酶全酶;第一个磷酸二酯键生成后,σ亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于DNA模板上,酶沿DNA链前移,进入延长阶段。 ;RNA-pol的移动;E.coli的转录起始;1、RNA聚合酶(核心酶)
与DNA模板紧密结合,沿3’→5’方向移动
解旋作用:DNA解开17 bp(拓扑异构酶)
聚合功能:NTP不断聚合(形成磷酸二酯键 )
RNA链不断延长。 (不具外切酶功能)
2、杂交螺旋
RNA-DNA形成12bp长的杂交螺旋
转录产物RNA沿5’→3’方向脱落、延长
RNA延长速度:40个核苷酸/秒/每分子酶
DNA双螺旋随后渐渐恢复(拓扑异构酶);RNA-pol (核心酶)—— DNA ···· RNA;第27页/共79页;;;依赖Rho 因子的转录终止
非依赖Rho因子的转录终止;ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量46kD。
ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合力最强。
ρ因子还有ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。;ρ因子的作用原理:;第33页/共79页;目前认为,ρ因子终止转录的作用是:与RNA转录产物结合,结合后ρ因子和RNA聚合酶都可发??构象变化,从而使RNA聚合酶停顿,解螺旋酶的活性使DNA/RNA杂化双链拆离,利于产物从转录复合物中释放 。;(二) 非依赖 Rho因子的转录终止;5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU... 3` ;茎环结构使转录终止的机理:;第38页/共79页;;第三节 真核生物的转录过程;一、真核生物RNA聚合酶(三种);二、转录因子(真核生物);真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化
启动子(promoter):是DNA上的特殊的序列,其中最重要的保守顺序称TATA (box)盒子,是RNA聚合酶结合部位
转录起始时,RNA-pol不直接结合模板启动子区需要转录因子先与启动子区结合,从而刺激转录。;一个典型的真核生物基因上游序列:;;真核生物RNA聚合酶Ⅱ转录的基因及其转录起始上游序列;第47页/共79页;二 、转录延长;转录延长中的核小体移位;三、转录终止;真核生物的转录终止及加尾修饰;真核生物RNA转录后的加工;几种主要的修饰方式;mRNA的加工;第55页/共79页;(一)首、尾的修饰;帽子结构;5? pppGp…;第59页/共79页;加入polyA;(二)mRNA的剪接;hnRNA是mRNA的前体,大几倍,几十倍;剪接接口: 5’ GU…AG-OH3’;第一次转酯反应;pG-OH
(ppG-OH, pppG-OH);鸡卵清蛋白基因;鸡卵清蛋白成熟mRNA与DNA杂交电镜图;?修饰包括mRNA分子核糖上2’-羟基的甲基化反应和嘌呤碱的甲基化反应。(胞浆和核内)
编辑(editing)是指在转录后对mRNA序列中的碱基进行变换的过程
;; rRNA前体的转换 ;真核细胞的5S RNA基因与其他rRNA基因相分开 ,分别有 polⅢ和 polⅠ转录生成。
28S、5.8S与相关的蛋白质一起组成核
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