基于深度学习的蛋白质卷曲螺旋结构特征预测实现方法.pdfVIP

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2023-07-02 发布于四川
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基于深度学习的蛋白质卷曲螺旋结构特征预测实现方法.pdf

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一种基于深度学习的蛋白质卷曲螺旋结构特征预测实现方法，使用两层卷积网络和两层双向长短时记忆网络分别提取序列的局部特征以及全局特征，经拼接后通过残差网络预处理，再分别经卷曲螺旋区域预测网络、七元标记位置预测网络以及寡聚体状态预测网络预测得到卷曲螺旋的卷曲螺旋区域、七元标记位置以及寡聚体状态。本发明采用自注意力机制使得模型自动关注卷曲螺旋中对预测至关重要的位置，并采用多类别交叉熵作为损失函数。模型最终的损失函数是三个网络损失函数的加权，以及网络参数的正则项。

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113724780 A (43)申请公布日 2021.11.30 (21)申请号 202111084566.3 (22)申请日 2021.09.16 (71)申请人上海交通大学地址