分子流行病学在疾病预防控制中的应用预防级.pptVIP

illumina 高通量基因分型平台 现在是31页\一共有82页\编辑于星期四 SNPstream基因分型系统 现在是32页\一共有82页\编辑于星期四 Automated Liquid Handler SpectroPREPTM Nanoliter Dispenser SpectroJETTM MALDI-TOF Mass Spectrometer SpectroREADERTM Automated Analysis SpectroTYPERTM Miniaturized Biochip SpectroCHIPTM MassARRAY Integrated Components 现在是33页\一共有82页\编辑于星期四 核酸分子杂交 现在是34页\一共有82页\编辑于星期四 蛋白质检测鉴定系统 SDS现在是35页\一共有82页\编辑于星期四 酶联免疫吸附试验（ELISA） 现在是36页\一共有82页\编辑于星期四 高效液相色谱(HPLC, LC/MS/MS) 现在是37页\一共有82页\编辑于星期四 Accessible Genome and Genetic Variation database Affordable High-throughput Platform Service 现在是38页\一共有82页\编辑于星期四 分子流行病学在疾病预防和控制中的应用 （一）病因的探讨及病因致病机制的研究 1、传染病病因及流行规律的探讨 研究已知或新发传染病的病原体和流行特点 病原学诊断（基因诊断）、基因分型 研究分布特点，传染源追踪和传播途径确定 观察病原体在体内持续时间和消长规律 现在是39页\一共有82页\编辑于星期四 丙型肝炎病毒基因分型 Simmonds双等级基因命名系统 病原体基因分型 不同基因型HCV，其临床表现以及对抗病毒治疗的敏感程度有显著差异。 1b型对干扰素治疗的持续应答率为20%，而非1b型对干扰素治疗的持续应答率可达60-70%。 现在是40页\一共有82页\编辑于星期四 1a, 1b 2a, 2b, 3a 1a, 1b 2a, 2b, 2c, 3a 4 5a 1b 1b, 6 1b, 3a 1b, 3a 3b 4 Clinical Microbiology Reviews, 2000, 13(2) 223-235 HCV 1b型是我国主要流行型 1a, 1b, 2b, 3a 2a 现在是41页\一共有82页\编辑于星期四 如SARS 在广东流行可分三个阶段: 早期由病人分离到的SARS 病毒与果子狸分离到的SARS 病毒高度同源,因此怀疑SARS 是一种动物来源的疾病。 上海预防医学杂志2005 SARS病毒来源及变异分析 中期SARS 病毒分子结构稳定, 病毒传播力强, 超级传播事件发生多。 后期SARS 病毒碱基缺失可达几百个，病毒的传播力大大减少。 现在是42页\一共有82页\编辑于星期四 案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一千余名患者进行HIV检测，共发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。 那么这7名HIV感染者是否与该牙医有关呢？ 传染病传播途径分析 Science 1992 现在是43页\一共有82页\编辑于星期四 针对这一问题可采取的分析方法： 1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。 2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差异，分析不同病例感染株遗传关系的远近。 Science 1992 现在是44页\一共有82页\编辑于星期四 与牙医感染株的遗传变异性比较 与对照感染株的遗传变异性比较 现在是45页\一共有82页\编辑于星期四 病人D 当地对照 牙医及病人A,B,C,E,G 病人F 进化树分析 现在是46页\一共有82页\编辑于星期四 以结核为例：与结核病人密切接触，感染和发病的危险增加。这些接触者与源病例之间，是否产生了结核分枝杆菌的传播？ 开展结核病成“簇”性研究，可以从分子角度解答这样的问题。 成簇的过程就是用聚类分析对分离株的基因进行分型或分群的过程，可以分析结核病的传染源和传播途径。 揭示传染病传播机制 现在是47页\一共有82页\编辑于星期四 结核杆菌DNA指纹图谱有助于基因分型 流行病学常用 结核杆菌基因分型方法 IS6110-RFLP Spoligotyping MIRU-VNTR 现在是48页\一共有82页\编辑于星期四 B