用于分析染色质相互作用数据的方法和设备.pdfVIP

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2023-05-26 发布于四川
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为了分析染色质的空间组织，计算装置可以使用二叉有哪些信誉好的足球投注网站树将基因组元件触点或读段编译到可变大小的箱中。所述箱可被选择用于各自表示基因组内不同的切割位点增量或功能元件，如基因、TAD、染色质状态片段、环状结构域、染色质结构域等。选择两组箱来生成箱对的正方形基因组矩阵，其中每个组表示所述矩阵的轴。然后将归一化方法应用于具有可变大小和/或形状的所述箱对的相互作用频率以生成每个箱对的经归一化的相互作用频率。可以使用所述经归一化的相互作用频率来识别具有富集的触点和贫化的触点的箱对，以进行各种分析，包含基因组变体

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112272849 A (43)申请公布日 2021.01.26 (21)申请号 201980034320.X (74)专利代理机构中国专利代理(香港)有限公