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《综合实验II(遗传)》教学大纲
课程编码
1151752020312
课程类别
专业系列课
课程名称
综合实验II(遗传)
英文名称
Comprehensive Experiment II(Genetics)
学分
1.5
建议修读学期
第5学期
总学时数
54
其中：实践学时
54
实验学时
54
其他学时
0
课外学时数
54
预修课程
遗传学、分子生物学、表观遗传学
考核方式
研究综述+实验设计+实验操作+实验记录+研究论文
适用专业
生物技术
一、课程目标
通过对本课程的学习：
具有独立判断生物学及其相关学科的科学问题的能力；能够通过独立思考和自主分析，解决学习和科研实践中所存在的问题。(支撑毕业要求3. 创新能力)
具有团队意识和合作精神，以及一定的组织和协调能力，掌握团队协作学习知识和技能的方法。（支撑毕业要求5. 交流合作）
具有良好的自我管理能力，具备通过阅读、听讲、研究、观察、实践等手段自主获取知识的能力。（支撑毕业要求6. 自主学习）
二、课程目标与毕业要求的对应关系
毕业要求
指标点
权重
课程目标
3．创新能力
3-2. 具有独立判断生物学、生物技术及其相关学科的科学问题的能力；能够通过独立思考和自主分析，创新性的解决学习和科研和产业开发实践中所存在的问题。
0.3
课程目标1
5．交流合作
6-2. 具有团队意识和合作精神，以及一定的组织和协调能力，掌握团队协作学习知识和技能的方法。
0.3
课程目标2
6. 自主学习
6-1. 具有良好的自我管理能力，具备通过阅读、听讲、研究、观察、实践等手段自主获取知识的能力。
0.4
课程目标3
三、教学内容、重难点和课时安排
模块一、水稻纯合突变体和野生型的愈伤组织的DNA的提取（10学时）
1．水稻叶片和愈伤组织的DNA提取 （支撑课程目标1、3） （8学时）
2．DNA质量和浓度检测 （支撑课程目标1、3） （2学时）
学习要求：掌握植物基因组DNA提取方法和DNA质量的评估方法；能够与组员合作完成实验内容。
模块二、突变体基因型的鉴定（8学时）
1．讲解引物设计软件使用方法和引物设计原则 （支撑课程目标1） （1学时）
2．设计引物 （支撑课程目标1） （1学时）
3. PCR扩增 （支撑课程目标1、2） （4学时）
4. 结果检测：琼脂糖凝胶电泳 （支撑课程目标1、2） （2学时）
学习要求：了解引物设计的基本原则，了解PCR反应的原理，引物退火温度和长度的设计原则，学会使用专用软件设计目标DNA扩增引物；能够与组员合作完成目标DNA片段的PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测。
模块三、转座子激活的检测（10学时）
1．转座子激活检测相关知识讲解 （支撑课程目标1、2） （2学时）
2. 学生以小组为单位，通过自主查阅文献，从以下研究方案中自主选择1项
2.1．使用文献报道扩增引物检测基因组内DNA转座子mPing的多态性（支撑课程目标1、2）（8学时）
2.1.1基因组内转座子多态性分析原理 （2学时）
2.1.2 PCR扩增 （4学时）
2.1.3结果检测：琼脂糖凝胶电泳 （2学时）
2.2. 基因组重测序检测转座子激活（支撑课程目标2、3）（8学时）
2.2.1 基因组重测序原理讲解 （2学时）
2.2.2 DNA质量和浓度检测 （2学时）
2.2.3 测序数据分析 （4学时）
学习要求：了解什么是转座子，转座子为什么会激活，转座子激活的原理和常用的检测方式；学生能够与组员合作，自主查阅文献，设计转座子检测实验方案，并与组员合作，按照实验方案完成转座子活性检测。
模块四、DNA甲基化检测和变异分析（12学时）
1．DNA甲基化检测相关知识讲解 （支撑课程目标1、2） （2学时）
2. 学生以小组为单位，通过自主查阅文献，从以下研究方案中自主选择1项：
2.1. DNA甲基化敏感限制性酶切法※ （支撑课程目标2、3） （8学时）
2.1.1 DNA甲基化敏感限制性酶切法原理讲解 （2学时）
2.1.2 DNA甲基化敏感限制性内切酶酶切实验 （4学时）
2.1.3 结果检测：琼脂糖凝胶电泳 （2学时）
2.2. 特定位点的亚硫酸盐测序法检测DNA甲基化※ （支撑课程目标2、3） （8学时）
2.2.1 亚硫酸盐测序法原理讲解 （1学时）
2.2.2 亚硫酸盐测序法引物设计 （1学时）
2.2.3 亚硫酸盐处理和产物回收、连接、转化 （4学时）
2.2.4 阳性克隆筛选、测序 （2学时）
2.2.5 测序数据分析计算DNA甲基化水平 （
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