核酸电泳常见问题与解决方案.pdfVIP

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问题 可能原因 解决方法 DNA Marker 降解 核酸酶污染 每次吸取时更换灭菌枪头, 勿将电泳缓冲液 带入管中;用后密闭 4 °C 保存 保存不当 4 °C 或 - 20°C 保存,避免多次反复冻融; 不可加热 DNA Marker 无法 琼脂糖质量差 使用质量可靠的琼脂糖制胶 正确分离 电泳缓冲液多次使用后失效 更换缓冲液 条带黯淡 核酸浓度过低 增加上样量 核酸降解 使用不含核酸酶的试剂和耗材制备样品 DNA条带被示踪染料掩盖 提高上样量; 避免使用与目的片段迁移率相 同的示踪染料 条带模糊或弥散 电泳缓冲液多次使用后失效 更换缓冲液 核酸部分降解 使用不含核酸酶的试剂和耗材制备样品 核酸样品纯度差,含有 DNA结合蛋 酚 / 仿抽提或乙醇沉淀去除蛋白、盐份等杂 白或高浓度的盐份 质 电压过低,电泳时间过长 根据凝胶大小和电泳缓冲液类型, 使用适当 的电压进行电泳 染色时间过长或拍照前放置过久, 电泳结束后及时观察、拍照 DNA条带弥散 条带缺失 DNA条带分子量过大 使用脉冲凝胶电泳 分子量接近的 DNA条带没有分开 选择适当的凝胶浓度进行电泳 电泳缓冲液使用不当 SD和 TBE缓冲液适于分析较小分子量的 DNA 片段,大片段分子不能完全分离; TAE缓冲 液不适于分离很小的 DNA片段 电泳时间过长或电压过高, DNA走 缩短电泳时间,调整电压 出凝胶 电极插反, DNA走出凝胶 正确连接电极方向 条带大小不正确 核酸降解或形成聚合物 加热处理或重新制备样品 λ DNA 酶切 Marker 的 cos 位点复 电泳前 65°C 加热 5 分钟,冰上冷却 5 分钟 性 以后再上样 相同分子量的 DNA片段由于结构或 判断 DNA分子是否有特殊结构, 如缺口、 超 序列的差异而有不同的迁移率 螺旋、二聚体等;富含 AT 碱基的 DNA迁移 率比同分子量富含 GC碱基的 DNA片段慢

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