传统多相分类及高通量测序结合研究极端环境微生物资源与进化微生物学专业论文.docxVIP

浙江大学硕士学位论文 浙江大学硕士学位论文 目录 摘要 微生物是地球上分布最广，种类最繁多的生物，参与到地球上的每一个环节 中，小到物种间的相互作用，大到全球的碳循环，微生物都是不可或缺的一个环 节。本研究主要关注的是海洋环境微生物的新种分离、资源利用以及新疆盐湖环 境的古菌资源的分离以及嗜盐古菌的进化分析。 丰富的海洋微生物资源为我国药物研发，资源利用，进化研究提供了丰富的 样本，其极端的环境为研究生命的起源与演化，微生物系统进化提供了基础。 古菌同样在地球生境上分布广泛，主要分布在湖泊、大洋、热泉以及沉积物。 在生物地球化学过程中起着不可忽视的作用，且许多古菌生活在极端的环境中， 这些极端环境中许多被视为地球早起的生态环境，如高温，无氧等，因此古菌的 研究对研究生命的起源有重要意义。此外，古菌也是研究进化的良好载体。 本研究主要通过纯培养的方法挑取单克隆获得大量的古菌菌种，其中也包含 了蕴含各个种属的新种，通过1 6S以及不同种属特有的标记分子进行分类以及进 化研究。 随着高通量测序的兴起以及日渐低廉的测序成本，微生物研究也进入了高通 量的领域，不仅仅停留在纯培养的领域，例如16S标识的微生物多样性的研究， 以及通量更高的宏基因组研究。 本研究设计了多种培养基对选取自盐湖、深海底泥、大洋水样的样品进行菌 株分离。获得三株疑似新种，包括一株古菌和两株细菌。探索不同培养基对于分 离的效果的改善。并以HT7．21代表Maribacter属的新种Maribacter thermophiles 进行了基因组注释分析，并构建实验室基因组分析平台。 对于分离自盐湖的一株疑似新种直接进行全基因组测序，并选取近缘菌株进 行比较基因组学分析，以期找到环境适宜相关的基因以及进化上的适应性。 关键词：高通量；多相分类学；基因组注释分析；比较基因组 万方数据 浙江大学硕士学位论文 浙江大学硕士学位论文 目录 Abstract Microbes are the most widely distributed and the most in numbers and types，taking part in every cycle on the earth，from the interaction among different microbes to the globe carbon cycle．We concentrate on the new species isolation，resource utilization and species isolation and evolution analysis of archaea from salt—lake of Xinjiang Province． The abundant resource of marine provides US enough samples on studying drug reaserch，evolution analysis and resource utilization．The extreme environment is a excellent sample to study microbial origin and evolution，offering base for phyletic evolution． Archaean are also widely distributed，including lakes，oceans，hot springs and sediments．They play an import role in biological process．Besides，since many archaean live in extreme environments which are regarded as the early environments of the ecological earth，such as high temperature，anaerobic and SO on．In addition， archaea are good models to study evolution． The archaean in this study were obtained using pure culture method，including some new species of different g