基于蛋白质相互作用网络的代谢pathway预测教育技术学专业论文.docxVIP

优秀毕业论文 精品参考文献资料 no norm alized L aplacian m atrix ) an d w e discuss th e sp ecific application of sp ectral clu sterin g algo rith m in th e P P I n etw o rk an aly sis.T h e exp erim ental resu lt in dicates th e practicalsignificance o f th e sp ectral clu stering algorithm . K ey w o rd s: m etabo lic p ath w ay, p rotein-p rotein interaction , com p lex n etw ork , hierarchical clu sterin g ,S p ectral clu sterin g in 天 天 津 师 范 大 学 硕 士 学 位 论 文 目 录 第 一 章 m it 1 1.1 生 物 信 息 学 1 1.2 机 器 学 习 2 1.3 基 于 机 器 学 习 的 生 物 信 息 学 2 1.4 论 文 的主 要 研 究 内容 及 结 构 安 排 3 1.4 .1 论 文 的 主 要 工 作 3 1.4 .2 本 文 的 章 节 安 排 3 第二章 代谢 p athw ay 与蛋 白质相互作用 6 2.1 代谢 pathw ay 6 2.1.1 代谢 pathw ay 预测 的研 究现状 8 2.1.2 pathw ay 预测研究中的关键 问题 10 2 .2 蛋 白质 相 互 作 用 1 1 2 .2 .1 P P I 网络 的 统 计 参 数 12 2 .2 .2 P P I 网络 的 基 本 特 征 14 2 .2 .3 蛋 白质 相 互 作 用 的研 究 应 用 15 2 .3 常 用 聚 类 算 法 16 2 .3 .1 基 于 层 次 的 方 法 16 2 .3 .2 基 于 划 分 的 方 法 17 2 .3 .3 基 于 密 度 的 方 法 18 2 .3 .4 基 于 模 型 的方 法 19 第三章 基于 P P I 网络 的 p athw ay 预测基本框架 20 3 .1 主 要 数 据 源 2 0 3 .1.1 U n iP ro t 数 据 库 2 0 3 .1.2 D IP 数 据 库 2 0 3 .1.3 K E G G 数 据 库 2 1 3 .2 问 题 2 1 3 .3 方 法 过 程 22 3 .4 实 验 环 境 2 3 3 .5 实 验 数 据 24 天 天 津 师 范 大 学 硕 士 学 位 论 文 3 .6 预 测 结 果 的 评 价 方 法 2 5 第 四 章 基 于 概 率 模 型 的 P P I 网 络 层 次 聚 类研 究 27 4 .1 基 于 概 率 模 型 的 层 次 聚 类 2 7 4 .2 关 键 参 数 2 8 4 .2 .1 相 关 性 的 定 义 2 8 4 .2 .2 层 次 聚 类 的 阈 值 2 9 4 .3 方 法 改 进 3 0 4 .3 .1 统 计 分 析 及 结 果 3 0 4 .3 .2 相 关 性 的 重 定 义 32 4 .3 .3 方 法 过 程 3 2 4 .4 实 验 结 果 与 分 析 3 3 第 五 章 基 于 谱 划 分 的 P P I 网 络 聚 类 研 究 4 0 5 .1 谱 聚 类 40 5 .2 基 于 N o rm al 矩 阵 的 谱 平 分 法 4 1 5 .2 .1 谱 平 分 法 的 基 本 思 想 4 1 5 .2 .2 基 于 规 范 化 邻 接 矩 阵 的 谱 平 分 法 4 2 5 .2 .3 相 关 性 系 数 4 2 5 .2 .4 方 法 过 程 4 3 5 .3 实 验 设 计 与 分 析 4 4 第 六 章 总 结 与 展 望 4 6 6 .1 论 文 总 结 4 6 6 .2 进 一 步 展 望 4 6 参 考 文 献 4 8 攻 读 硕 士 学 位 期 间 发 表 的 论 文 及 参 与 项 目 52 翻 5 3 天津师范大学 天津师范大学硕士学位论文 第 一 章 绪 论 1 .1 生 物 信 息 学 生 物 信 息 学 （b io in form atics) 是 生 物 学 与 计 算 机 科 学 以及 应 用 数 学 等 学 科 相 互 交 叉 而 形 成 的 一 门 新 兴 学 科 ，它 通 过 对 生 物 学 实 验 数 据 的获 取 、 加