- 1、本文档共105页,可阅读全部内容。
- 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
泛耐药鲍曼不动杆菌临床株w61耐药与播散机制的基因组学研究临床医学内科学传染病学专业论文
天津医科大学博士学位论文中文摘要
天津医科大学博士学位论文
中文摘要
鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii,Ab)是医院内感染中常见的一种病 原菌,其耐药问题日趋严重,中国CHINET细菌耐药性监测报告,2010年鲍曼 不动杆菌泛耐药株分离率高达21.4%,较2009年17.0%又有所增加,且均高于 同年铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、肠杆菌科细菌的泛耐药株分离率。多重耐 药和泛耐药的鲍曼不动杆菌,已成为临床亟待解决的棘手难题。近年来,随着 高通量测序技术的快速发展,基因组学和比较基因组学的研究方法为细菌学领 域引入新的研究平台。本实验采用微生物学、分子生物学和生物信息学分析方 法揭示泛耐药鲍曼不动杆菌临床株W61的多重耐药和耐药播散的机制,为指导 临床合理使用抗菌药物,避免或减少细菌耐药性的出现,防控细菌耐药播散, 研发新型抗菌药物和新作用靶位提供依据。
研究目的
1、 了解泛耐药鲍曼不动杆菌临床株W61的基因组基本特征,分析其多重耐药 表型与耐药基因型。
2、 了解泛耐药鲍曼不动杆菌临床株W61基因组中外排泵系统的分布,分析外 排泵(AdeABC、AdeIJK、AdeFGH、AbeM、AbeS、CraA、MdtL、AmvA及 ABTJ 00034/35/36、ABTJ 00275/276/277等5个功能未知的外排泵)和外膜蛋 白(OmpA、OmpW)的表达,探索外排泵和外膜蛋白在菌株多重耐药中的作用。
3、 了解泛耐药鲍曼不动杆菌临床株W61基因组中可移动元件(整合子、转座
子、插入序列、质粒)的分布,探讨耐药播散机制。
研究方法
1、 菌株收集与药敏试验:收集自2009年天津市某三级甲等医院临床分离的鲍 曼不动杆菌W61,经常规、生化、APl20NE纸条鉴定。采用微量肉汤稀释法和 琼脂纸片扩散法测定鲍曼不动杆菌W61对16种常用抗菌药物(哌拉西林他唑巴 坦、头孢氨噻肟、头孢他啶、头孢曲松、头孢哌酮、头孢吡肟、头孢哌酮/舒巴 坦、阿米卡星、庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、氧氟沙星、莫西沙星、亚 胺培南、美罗培南、多粘菌素)的MIC值(或抑菌圈直径),确定其耐药表型。
2、全基因组高通量测序与序列分析:应用Roche 454 FLX测序平台,对鲍曼不
动杆菌临床株W61进行全基因组测序,利用相关软件和聚合酶链式反应(PCR)
天津医科大学博士学位论文填补空缺片段,拼接完整的基因组序列,提交Genbank。应用BASys细菌注释
天津医科大学博士学位论文
填补空缺片段,拼接完整的基因组序列,提交Genbank。应用BASys细菌注释 系统进行基因组和质粒的基因注释,分析菌株耐药表型与耐药基因型的关系。 3、 泵抑制剂干预试验与外排泵及外膜蛋白基因表达检测:采用微量肉汤稀释 法测定未加用和加用泵抑制剂CCCP时鲍曼不动杆菌临床株W61对8种抗菌药
物(左氧氟沙星、环丙沙星、氧氟沙星、氯霉素、庆大霉素、阿米卡星、头孢 他定、头孢哌酮/舒巴坦)的MIC值,了解泵抑制剂对菌株耐药表型的影响。应 用TransDB数据库分析多重耐药株W61基因组中外排泵系统的分布情况。选取 鲍曼不动杆菌ATCCl7978为对照株,以recA为内参基因,采用实时荧光定量 RT—PCR方法对鲍曼不动杆菌W61和ATCCl7978的13种外排泵基因(adeB、
adeJ、adeG、abeM,abeS、craA,mdtL,amvA及ABTJ一00035、ABTJ一00276 等5个功能未知的泵基因)和2种外膜蛋白基因(ompA、ompW)mRNA的表 达进行相对定量分析。泛耐药株W61外排泵AdeABC的调控系统AdeRS、外排
泵ABTJ 00034/35/36上游调控序列ABTJ 00033和外排泵AdeFGH的调控系统 AdeL的结构基因,与GenBank公布的ATCCl7978相应序列进行比对分析。 4、可移动元件分布:应用Genbank.nr和IS finder数据库,经序列比对分析鲍曼 不动杆菌临床株W61基因组中可移动元件(整合子、转座子、插入序列、质粒) 的分布及其携带的耐药基因,分析可移动元件在菌株耐药性的水平播散中的作 用。
研究结果
1、 药敏试验结果:鲍曼不动杆菌临床株W61对抗假单胞菌头孢菌素、碳青霉 烯类抗菌药物、含舒巴坦的复合制剂、氟喹诺酮类抗菌药物和氨基糖苷类抗菌 药物均耐药,对多粘菌素敏感,为泛耐药株。 2、基因组序列分析:泛耐药株W61基因组(Genbank登录号CP003500)全长
3964912bp,平均GC含量为39.11%,包含3731个蛋白质编码基因,6个rRNA 编码基因,74个tRNA编码基因;泛耐药株W61携带2个质粒,plasmidA全长 77528bp,
您可能关注的文档
- 风力发电机组控制系统的仿真设计实现软件工程专业论文.docx
- 青鹏软膏干预佐剂性关节炎大鼠作用研究中西医结合临床内科专业论文.docx
- 深海立管涡激振动疲劳损伤预报方法研究船舶与海洋结构物设计制造专业论文.docx
- 低破坏开发理念下的江平新城行政中心建筑布局研究建筑学专业论文.docx
- 多环芳烃和壬基酚及前体物在水沉积物界面分配行为研究环境科学专业论文.docx
- 人工设计蛋白质及其定向进化突变体的实验分析生物化学与分子生物学专业论文.docx
- 滴灌棉田水盐迁移规律及其改善棉花耐盐机制研究植物营养学专业论文.docx
- 表面等离子体共振谱仪用于糖蛋白的检测研究光学工程专业论文.docx
- 多参数全固态血液分析传感器研究控制工程专业论文.docx
- 地面高层建筑对重庆轨道三号线隧道的影响研究建筑与土木工程专业论文.docx
最近下载
- 绿氢产业发展白皮书(2025年)-香橙会研究院.docx
- 浙江省温州市2023-2024学年高一下学期期末考试政治试题(解析版).docx VIP
- GB50009-2012 建筑结构荷载规范.pdf
- 水库调度工考试题库版与答案(926题).docx
- 河南省平顶山市2024_2025学年高二生物下学期期末考试试题含解析.doc VIP
- 2022年(广东)广州市中考数学试卷.pdf VIP
- 市政道路工程竣工验收方案.pdf VIP
- 急性重症胰腺炎护理查房PPT.ppt
- SONY索尼数码摄像机HDR-PJ820E用户说明书.pdf
- 《4.1 采集数据》教学设计教学反思-2023-2024学年中职信息技术高教版.pdf VIP
文档评论(0)