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基因组大小的比较(2) 基因组大小的比较(1) 遗传图谱:又称连锁图谱(linkage map),它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在群体中的出现频率皆高于1%)的遗传标记为“路标”,以遗传学距离(在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率,1%的重组率称为1cM)为图距的基因组图。 物理图谱:物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。 遗传图谱与物理图谱 随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。 基因图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能,最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。 序列图谱与基因图谱 后基因组时代 ( Postgenome era) * 人类基因组计划完成之后,生物学被重新划分为前基因组和后基因组两部分。 * 科学研究已开始进入“后基因组时代”。主要是开展蛋白质组的研究。 * 有科学家形象地说道:即使基因测序全部完成,也只好像是一本没有姓名、只有号码的电话簿。“后基因组时代”的最终目标,是要把深奥的DNA语言变成一本基因大百科全书。 比较基因组与功能基因组 (Comparative Genome Functional Genome) 什么是比较基因组学? 利用生物在进化上的亲缘关系,来比较它们与人类之间的相似与相异,即比较基因组学。 * 蛋白组(Proteome) 蛋白质组是指“一种基因组所表达的全套蛋白质”。 * 蛋白组学(Proteomics) 一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科。 * 蛋白组学与功能基因组学息息相关。 蛋白组学与功能基因组学 1.蛋白质分离和鉴定:2.翻译后修饰:翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定:如分析酶活性和确定酶底物,细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。4.对人类而言,蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康,主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质,而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。 蛋白质组学的研究内容 生物芯片 1 生物芯片 2 G.J.Mendel 1822—1884 Thomas Hunt Morgan 1866—1945 Crick 1916— ?Watson 1928— 基因组学为人类了解自我提供了基础 谢谢! 赵志辉 第九章 动物基因组学基础(二) 吉林大学畜牧兽医学院 基因组水平的遗传 主要内容 第一节 基因组及基因组学 第二节 基因组的序列组织 第三节 人类基因组计划 第四节 DNA分子标记 第五节 染色体外基因组 第六节 基因组印记 第一节 基因组及基因组学 (Genome and Genomics) Genome and Genomics 概念 Genome=Gene + Chromesome 一个配子中染色体遗传物质的总和; 细菌或噬菌体:单个染色体所含的全部 DNA分子或遗传信息 二倍体生物:维持配子或配字体正常功能 的最基本的一套染色体DNA 及其遗传信息。 C值矛盾 C值:基因组的大小通常以一个基因组中的DNA含量来表示,成为生物体的C值(C Value)。 ⑶基因组的基因数目 表3-3 不同生物的基因数目 基因组 1%编码蛋白,99%垃圾序列 非结构基因的DNA序列的结构与功能? C值矛盾匝生物学功能和进化中的意义? 基因组学 结构基因组学 功能基因组学 对基因组物理结构的作图和测序的研究 应用整体的研究技术阐明这些基因和蛋白的生物学功能 基因组学研究的发展 基因组学(genomics) 转录组学(transcriptomics) 蛋白质组学(proteomics) 表型组学(phenomics) 系统
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