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一种通用的、基于agent的生物资源整合架构
《上海生物医学工程》杂志 年第 卷第 期
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一种通用的、基于!#$% 的生物资源整合架构
骆婷婷 马文丽 姚文娟 郑文岭
上海大学电子生物技术研究中心 (上海 ’’’( )
【摘要】 众所周知,随着基因组测序工作的蓬勃发展和后基因组时代的到来,生物信息学数据呈指数级
增长。生物界在享受着资源共享所带来便利的同时,也随着数据总量和复杂性的不断增加而变得异构化和
分布化。目前,各种生物计算软件和数据库资源通常标准不一而且很难兼容。因此,如何在这些异构资源之
间实现数据集成与软件共享是有效利用生物信息资源的关键。为解决以上问题,本文提出了一种新型的数
据整合架构,该架构通过将)#* 服务与并行计算相结合的方法,轻松地实现了对异地资源数据的访问、提取、
转化以及整合。实验证明,本系统在处理异构、海量数据方面有着巨大的计算潜力。
【关键词】 生物信息学 异构资源 、 服务 并行计算
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