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并行计算实环境搭建指南
并行计算实验环境搭建指南 一、资源列表 本系列实验所需软件和参考资料均可从课程网站下载: /orgs/hpclab/course/graduate2011/ 集成开发环境 CodeBlock 10.05(含mingw版) PThread for Win32 2.8.0 Mpich.nt.1.2.3 Hadoop 0.20.2 SSH客户端 二、CodeBlock安装配置 配置编译器 位置:menu-settings-Complier and Debugger 在设置面板中Selected Compiler选项中选GNU GCC Compiler 三、PThread配置 双击执行pthreads-w32-2-8-0-release.exe 解压到指定目录,假定为 $PTHREAD_INSTALL, 在CodeBlock中新建Console Application类型的工程 设置编译选项,menu-project-build options (参见图1) 再次确认编译器为GNU GCC 选中面板Search Directories 在Complier的有哪些信誉好的足球投注网站路径中加上$PTHREAD_INSTALL\Pre_built.2\include 在Linker的有哪些信誉好的足球投注网站路径中加上$PTHREAD_INSTALL\Pre_built.2\lib 设置链接选项,menu-project-build options 选中面板Linker settings 在链接库的路径中加上 $PTHREAD_INSTALL\Pre_built.2\ lib\libpthreadGC2.a 编译示例程序 运行示例程序,在cmd窗口中直接执行编译后生成的exe文件 (如果提示找不到链接库,可将pthreadGC2.dll拷贝到可执行文件的目录下) 图1. PThread配置例 四、OpenMP配置 在CodeBlock中新建Console Application类型的工程 设置编译参数,menu-project-build options,在Compiler Setting里的Other Options中粘贴-fopenmp(参见图2) 设置链接参数,在Link Setting里的Other Options中粘贴-lgomp –lpthread(参见图3) 编译示例程序 运行示例程序 如果提示找不到链接库,可将pthreadGC2.dll拷贝到可执行文件的目录下;并在CodeBlock的安装目录下的mingw文件夹中找到libgomp-1.dll,拷贝到可执行文件的目录下 图2. OpenMP编译参数配置例 图3. OpenMP链接参数配置例 五、MPI安装配置 双击执行mpich.nt.1.2.3.exe,安装时要选择全部组件,否则只能在本机上运行,假定安装目录为$MPI_INSTALL。 图4. MPICH.NT 安装 在CodeBlock中新建Console Application类型的工程 设置编译参数,menu-project-build options,选中Search Directories 在Complier的有哪些信誉好的足球投注网站路径中加上$MPI_INSTALL\ SDK.gcc\include 在Linker的有哪些信誉好的足球投注网站路径中加上$MPI_INSTALL\SDK.gcc\lib 设置链接参数,menu-project-build options,在Link Setting里的Other Options中粘贴-lmpich -lws2_32 (参数设置方法参考OpenMP的配置) 编译示例程序 运行程序 Dos命令行方法: 在我的电脑上点右键,属性-高级-环境变量,编辑系统变量Path,添加$MPI_INSTALL\mpd\bin。(用分号隔开) 在命令行下切换到编译后的可执行文件所在目录 执行:mpirun –np proc_num exe_filename proc_num :进程数, exe_filename :可执行程序名 输入用户名和密码(注:MPI不允许空密码) 可视化方法(参看图5-6): 开始-所有程序-MPICH-mpd-MPIRun 选择可执行程序,设置进程数,执行 输入用户名和密码 图5-6. MPI程序的可视化运行 六、MPI多机运行的配置 确保各个机器上均正确安装了MPI 确认各个机器的计算机名,确保没有重名。 (计算机重命名:我的电脑上点右键,属性-计算机名,点击“更改”,输入新的计算机名,需要重新启动。) 为各个机器统一用户名和密码 临时关闭Window防火墙 用MPIConfig.exe查找并确认各个计算节点,(参见图7) 开始-所有程序-MPICH-Remote Shell-MPI Configuration Too
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