第一章微生物的分类与鉴定(2学时)PPT.ppt

大肠杆菌的几项生理生化测定结果 API细菌数值鉴定系统 二、微生物的鉴定 （一）形态学特征测定 （二）生理生化特征测定 （三）血清学试验 （四）核酸的碱基序列分析 （五）蛋白质的氨基酸序列分析 （三）血清学试验 抗血清的制备：微生物细胞或代谢产物注射小白鼠或家兔，采血后制备成抗血清 凝聚试验：制备待检菌的菌悬液；取1滴于洁净的玻片上，加入抗血清混合， 10s内观察菌体的凝聚现象 二、微生物的鉴定 （一）形态学特征测定 （二）生理生化特征测定 （三）血清学试验 （四）核酸的碱基序列分析 （五）蛋白质的氨基酸序列分析 （四）核酸的碱基序列分析 1、G+C百分比的测定 2、核酸杂交 3、16SrRNA碱基测序 1、 G+C百分比的测定 测定方法：G+C含量越高，双链结合牢固，Tm越高；热变性温度（Tm）是指紫外吸收(OD260)增加的中点值所对应的温度 应用：同属不同种G+C含量差别应低于10-15%，同种不同菌株G+C含量差别应低于4-5% 2、核酸杂交 基本原理：不同菌种的同源序列之间互补结合形成杂合双链；杂交率越高，其亲缘关系就越近 具体方法：DNA-DND杂交，DNA-rRNA杂交，核酸探针 应用：杂交同源性在20~60%是同属不同种，在60%以上为同一个种，超过70%为同一个亚种 * 环 境 微 生 物 学 Environmental Microbiology 洪永聪 青岛农业大学生命科学学院 第一章 微生物的分类与鉴定（2学时） 一、微生物的分类 二、微生物的鉴定 三、微生物菌种的保藏 分类、鉴定与命名 分类（classification）：根据各种生物的相似性和进化关系将其分为类群，排放在适当的分类单元中 鉴定（identification）：是分类的操作过程，经过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群 命名（nomenclature）：根据命名的国际法规对所鉴定的菌株给以科学名称（学名） 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （一）微生物的分类单元 界 Kingdom 门 Phylum 纲 Class 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species ----------------------- 亚种 subspecies，subsp. 变型 variety，var. 2、变型的概念 变型（ variety，var.）：是指微生物种以下，用某些特殊的特征加以区别的类群 血清变型（serovar）：表示抗原结构不同 生物变型（biovar）：表示特殊的生化或生理特征 致病变型（pathovar）：表示某专一致病性 噬菌体变型（phagovar）：表示对噬菌体的特异性反应 形态变型（morphovar）：表示特殊的形态特征 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 1、双名法 依照国际命名法则，采用瑞典科学家林奈（Carl von Linne）在1753年提出的双名法： 例1.金黄色葡萄球菌 Streptococcus aureus Rosenhach 1884 例2.枯草芽孢杆菌 Bacillu subtilis（Ehrenberg） Cohn 1872 （二）微生物的命名 斜体字 正体字（一般省略） 学名=属名+种加词+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份 2、三名法 学名=属名+种加词+符号subsp.或var.+亚种或变种加词 斜体字 正体字（一般省略） 斜体字 例1.苏云金芽孢杆菌腊螟亚种 Bacillus thuringiensis subsp. galleria 例2.丁香假单胞烟草致病变种 Pseudomonas syringae pv. tabaci 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （三）微生物的分类方法 1、经典分类法 2、化学分类法 3、数值分类法 4、分子遗传学分类法 1、经典分类法 经典分类法（classic taxonomy）：最常用的微生物分类方法，以形态学特征、生理生化特征、生态学特征等为依据， 对微生物进行分类 科以上的分类以形态结构特征为主，而科以下则以其生理生化特性和