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第一章 基因组概论PPT
第一章 基因组概论;第一节 基因组的功能单位——基因;基因的特点和鉴别方法 ; 1.开放阅读框(open reading frame, ORF)
*始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子。
*从mRNA中找出大的ORF来确定编码蛋白质的基因;
*适合于从DNA序列中鉴别原核生物基因和含少量内含子的真核基因。
*但对于一些短少的基因及一些内含子丰富的基因则很难鉴别。 ;2. 序列特征——密码子偏爱和剪接点; 除以上鉴定基因的五项标准之外,在实施过程中还有些麻烦的问题,如重叠基因、变通性断裂基因、假基因等。;第二节 基因组;1. 基因组大小与C值佯谬 ;Genomic Contents for Comparison;2. 基因总数与N值佯谬 ;;既然一切生物性状都是由基因决定的,那么生物体的DNA含量(C值)和质量(N值)就应该与生物进化阶梯及复杂性成正相关。
生物体结构与功能的复杂程度不仅取决于一定的基因数量,更重要的是在于基因功能及其相互作用网络的复杂性和精确性。
;第三节 基因组计划
(genome project);;HGP主要任务及内容;其他基因组计划;第四节 基因组学;后基因组计划;基因组学的延伸——模式生物基因组学
五大模式生物:E.coli、酿酒酵母、黑腹果蝇、秀丽线虫和小鼠,其序列分析被列为HGP的内容;
不同物种间功能基因有相当大保守性,如99%鼠基因与人对应;
最终目的:比较基因组学——比较不同物种的全基因组,增强对各基因功能的认识。
从分子水平上升到细胞水平——细胞计划
在阐明以基因为核心的生命物质的本质后,以信号传导为主线阐明在细胞内一切生命现象的本质。
1950年代生物学从细胞水平深入到分子水平是一次飞跃,但现在似乎又正返回到细胞水平!
新型学科与产业的发展——生物信息学和生物芯片;基因组与蛋白质组知识 库
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