gata3基因多态性与laptm5基因功能在儿童白血病中的研究-study on gata 3 gene polymorphism and la ptm 5 gene function in childhood leukemia.docxVIP
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gata3基因多态性与laptm5基因功能在儿童白血病中的研究-study on gata 3 gene polymorphism and la ptm 5 gene function in childhood leukemia
GATA-3基因多态性与LAPTM5基因功能在儿童白血病中的研究中文摘要第一部分GATA-3 SNPrs3824662与中国儿童急性淋巴细胞白血病的相关性目的:研究GATA结合蛋白3(GATA-bindingprotein-3, GATA-3)SNPrs3824662 在中国儿童急性淋巴细胞白血病(Acutelymphoblasticleukemia,ALL)中的分布,分析其与中国儿童急性淋巴细胞白血病的相关性。方法:收集137 例中国儿童ALL患者及389 例非血液系统恶性疾病人员EDTA 抗凝静脉血,提取DNA,采用巢式PCR 扩增包含GATA-3SNPrs3824662 位点的特异性条带后送公司测序,对其进行单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)分析。SPSS 18.0 分析软件对数据进行分析。结果:基因型C-C、C-A和A-A及等位基因C、A在对照和中国儿童ALL中比例没有差异,且与ALL的临床指标没有相关性。结论:GATA-3SNPrs3824662位点的多态性改变与中国儿童ALL的发病没有相关性,提示该位点与中国儿童ALL发病机制无关。关键词:中国儿童ALL;GATA-3;rs3824662位点;SNP第二部分儿童急性淋巴细胞白血病患者LAPTM5基因的表达及临床意义目的:溶酶体相关的五次跨膜蛋白(lysosomal-associated protein transmembrane5, LAPTM5)功能尚不十分明了,本研究通过定量PCR 检测儿童急性淋巴细胞白血病(Acutelymphoblasticleukemia,ALL)患者骨髓标本中LAPTM5mRNA的相对表达量,回顾性的分析其表达水平与儿童ALL临床特征的相关性。I中文摘要GATA-3基因多态性与LAPTM5基因功能在儿童白血病中的研究方法:病例来源于2012-2013 年期间在苏州大学附属儿童医院诊断和治疗的ALL患者144 例(初诊82 例、完全缓解54 例、复发8 例);40 例对照为同期的特发性血小板减少性紫癜(IdiopathicThrombocytopenicPurpura,ITP)或细胞株。应用定量RT-PCR 方法检测LAPTM5 基因的mRNA表达水平,利用SPSS18.0 统计学软件,分析LAPTM5 在儿童ALL中的意义。结果:初诊患儿LAPTM5mRNA的相对表达水平高于对照组,且差异有统计学意义(P0.001);在ALL患者中,初诊组和复发组LAPTM5 mRNA的表达水平均明显高于缓解组(P0.001,P=0.006),复发组与初诊组间没有差异(P=0.171),复发组高于对照组,差异有统计学意义(P=0.033),缓解组与对照组之间无差异(P=0.985)。初诊B-ALL中LAPTM5的表达明显高于儿童初诊T-ALL患者。LAPTM5的表达与骨髓原始细胞比例呈正相关(P=0.034, r=0.303);与年龄、性别、初诊白细胞计数(WBC)、血红蛋白(HB)、血小板(PLT)、C反应蛋白(CRP)、乳酸脱氢酶(LDH)、外周血幼稚细胞比例没有相关性,与儿童ALL的早期治疗反应及危险度分级也没有相关性;与诱导缓解治疗33 天时MRD的表达水平无相关性(P=0.695,r=-0.055)。结论:儿童初诊ALL高表达LAPTM5基因,在B-ALL中的表达高于T-ALL,与骨髓中白血病细胞数具有正相关性,但与疾病的预后指标没有相关性。关键词:儿童;急性淋巴细胞白血病;LAPTM5 基因;定量RT-PCR第三部分溶酶体五次跨膜蛋白基因的慢病毒载体的构建及在K562细胞中的表达目的:构建溶酶体相关五次跨膜蛋白(lysosomal-associated protein transmembrane 5,LAPTM5)基因的慢病毒表达载体,为研究该基因在白血病细胞中的功能奠定基础。方法:以NB4细胞的cDNA为克隆模板,通过PrimerPremier 5软件设计含有EcoRⅠ和BamHⅠ酶切位点的基因克隆引物,将LAPTM5CDS区域克隆入pLVX-IRES-Puro慢病毒表达载体。利用pLVX、pLP-VSVG、pLP1、pLP2慢病毒质粒包装系统,在293T细胞中采用磷酸钙沉淀法包装LAPTM5过表达慢病毒后侵染K562细胞,并对LAPTM5 过表达慢病毒进行一系列验证。结果:经过PCR 方法,有效扩增了LAPTM5基因编码区,构建了pLVX/LAPTM5慢病毒表达载体,测序分析表明所克隆的LAPTM5 基因编码区序列无误。DNA水平鉴定表明LAPTM5基因已成功插入到K562细胞基因组中,且在mRNA和蛋白水平较亲本株和转空载体细胞高表达。结论:成功地构建了人LAPTM5的慢病毒表达载体
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