一起青年学员急性传染性肺炎暴发的病因学探究-etiology of an outbreak of acute infectious pneumonia among young students.docxVIP

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2018-06-03 发布于上海
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一起青年学员急性传染性肺炎暴发的病因学探究-etiology of an outbreak of acute infectious pneumonia among young students.docx

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一起青年学员急性传染性肺炎暴发的病因学探究-etiology of an outbreak of acute infectious pneumonia among young students

序法直接查找病原体核酸，将扩增产物通过Solexa分析系统直接测序分析。结果在71例患者的急性期和恢复期血清中检测到抗肺炎支原体IgM和/或IgG阳性能诊断肺炎支原体感染者16例（22.5%）；实时荧光定量PCR检测甲、乙型流感病毒、嗜肺军团菌和支原体核酸均阴性；在非选择性扩增出的582750条带中，未见特征病毒序列出现；与限定物种数据库比对，不存在人流感病毒A型/B型、嗜肺军团菌、肺炎支原体和鼻病毒等呼吸道相关病原体的基因片段。结论本实验得出以下结论：1）血清学检测结果发现肺炎支原体的现症感染者为16例，患病率为22.5%。2）此次分子生物学检测失败可能与以下因素有关：所用检测技术尚不成熟在临床实践中应用有限及收集不当标本。3）呼吸道传染病应在早期及时收集呼吸道分泌物标本。[关键词]传染性肺炎；实时荧光定量PCR法；暴发；高通量扩增测序5AbstractEtiologicalinvestigationofanoutbreakofacuteinfectiouspneumoniainyoungstudentsBackgroundSincesevereacuterespiratorysyndromecoronavirusesandinfluentvirusAinfectionoutbreakin2003,moreandmorereportsfeverofunknownoriginorinfectiouspneumoniaweredocumentedthroughouttheword.Outofthemmycoplasmapneumoniae(MP)isacommoncauseofoutbreaks,whichaccountsforapproximately50%ofallcommunity-acquiredpneumonia.InfluentvirusA/BandL.pneumophilawerealsothecommoncausesforcommunity-acquiredpneumoniae(CAP).Respiratorytractinfectionsoccurredcommonlyinwinterandspring.M.pneumoniaeinfectionspreadsrapidlyinday-carecentre,jail,cruiseshipandmilitarycamp.ThetypicalrespiratoryinfectioncausedbyM.pneumoniaeisaslowlydevelopedpulmonaryandextra-pulmonarymanifestations,suchasimmunethrombocytopenia,erythemanodosum,acuteglomerulonephritis,reversiblemyeloradiculopathy,andrecurrentarterialthrombosin.Thehighrateofmorbidityreinforcestheneedsforcorrectdiagnosisintimeforadministeringproperantibiotictreatments.However,it’sdifficulttoidentifythepathogensattheearlytimeoftheoutbreak.Wetriedtoestablishthereal-timePCRassaysfordetecting5commonrespiratoryinfectionpathogensfortherapiddiagnosisinthissettings.Inthisstudyweconductedunbiasedhigh-throughputsequencing,real-timePCRassaysaswellasserologicalassaysforfinalidentifyingthepathogensofanoutbreaksofrespiratoryinfections.ObjectiveToestablish5real-timePCRassaysfordetectionof5commonrespiratorypathogensinconscriptswithfeverinamilitarycamps;andalsoaimedtoconfirmthecauseof6anoutbreakofacuteinfectiouspneumoniaatbiomolecularandserologicallevel.MethodsDoubleserafromseventy-onepatientsatacuteandrecoverystageo