修改常用软件整理草稿.docVIP

植物分子生物学实验室（3439）常用在线软件 何鹏 / 一. 蛋白结构分析 预测蛋白质跨膜区段： TMHMM Server v.2.0（http://genome.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）； 分析N-末端可能的信号肽： SigalP(http://www.ebs.dtu.dk/services/SignalP/) SIG-Pred (http://bmbpcu36.leeds.ac.uk/prot_analysis/Signal.html)； 分析蛋白二级结构组成： NPS@(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html）； 分析蛋白的特定结构域: SMART（http://smart.embl-heidelberg.de/）； 分析蛋白的三级结构: SWISS-MODEL（/） PDB（/pdb/home/home.do）； 分析叶绿体编辑位点在蛋白中的定位: RESOPS（http://cib.cf.ocha.ac.jp/RNAEDITING/.） 预测蛋白质定位： TargetP 1.1 Server (http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/） ChloroP 1.1 Server (http://www.cbs.dtu.dk/services/ChloroP/) 二. 核酸序列分析 序列比对软件： ClustalW: (http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw/index.html) 查找同源序列： BLAST: (/Blast.cgi) 查找ORF： ORF Finder:( /projects/gorf/)植物启动子序列分析： TSSP：（/berry.phtml?topic=tsspgroup=programssubgroup=promoter引物设计： DNA Calculator：（/calc/DNAcalc.asp） PCR引物设计序列反向互补： Reverse Complement：（/sms/rev_comp.html）Translate tool：（/tools/dna.html） 四．查阅外文文献NCBI：（/）Springer Link全文电子期刊Elsevier ScienceDirect 3）其他 DOAJ (Directory of Open Access Journals) /免费的全文科技学术期刊。现有2752种期刊，其中830种可以全文有哪些信誉好的足球投注网站。目前有140307篇文章。 HighWire Press??斯坦福大学图书馆的分支机构——HighWire出版社，拥有最大的免费期刊数据库，可以在线提供916种免费期刊High Wire Press。http/// 该网站号称拥有地球上最大最全的免费的科学文献全文数据库。五．一些数据库 RNA编辑数据库： REDIdb：（http://biologia.unical.it/py_script/search.html） 棉花EST库： Cotton Function Genomics Center：(/index.php?option=com_contenttask=viewid=13Itemid=28) CottonDB Webblast Server：( /cdbpages/webblast.html) 拟南芥PPR蛋白数据库： Arabidopsis PPR Protein Database：（.au/applications/ppr/ppr.php）这样的中心一共有三个，一是美国俄亥俄州立大学的生物资源中心(ABRC)，二是英国诺丁汉大学拟南芥菜种源中心(NASC)，三是德国科隆的DNA资源中心。这几个中心，尤其是ABRC和NASC分别负责向美洲及美洲以外的国家提供各种突变体及重组自交体系的种子美国俄亥俄州立大学的生物资源中心ABRC, Arabidopsis Biological Resource Center: (/ /) 英国诺丁汉大学拟南芥菜种源中心NASC, European Arabidopsis Stock Centre?: (/) [交流]【资源】【网址推荐】我所用的常用的生物数据库整理(已搜，无重)?现有的数据库一般可以分为初级数据库、二级数据库，有时也把有经验的研究者人工校对过的数据库单独分类，称为专家库。核酸序列数据库:比如GenBank(/)? ?? ?EMBL(European Molecular Biology Labor