中华按蚊化学感受蛋白(!KE)家族基因的全基因组鉴定和特征-昆虫学报.PDFVIP

昆虫 学 报 中华按蚊化学感受蛋白家族基因的 全基因组鉴定和特征分析 梅婷 何正波 王小婷 王婷婷 陈斌 重庆师范大学生命科学学院 昆虫与分子生物学研究所 媒介昆虫重庆市重点实验室 重庆 摘要 目的在全基因组水平鉴定中华按蚊化学感受蛋白 家族基因预测该家族基因的特征研究代表性双翅目昆虫基因的系统发育和进化 方 法在数据库中下载氨基酸序列作为询问序列通过和方法在全基因组水平 有哪些信誉好的足球投注网站和鉴定中华按蚊 冈比亚按蚊 埃及伊蚊 和致倦库蚊 的家族基因并命名通过生物信息学方法预测中华按蚊家族基因的特性 基因结构基因组定位剪切模式比值 保守结构域和蛋白质结构等通过 软件用 最大似然法 推断该家族基因的系统发育 结果 中华按蚊 冈比亚按 蚊埃及伊蚊和致倦库蚊基因组分别有 和 个家族基因 中华按蚊家族基因 都有全长的转录组序列编码 个氨基酸 个分布于 上 分布于 分别有 和 个选择 性剪切模式 的表达量最高其值达到 的端信号肽由 个 氨基酸组成均含有 个保守的半胱氨酸位点 和 这些位点界定 了两个二硫键 和 系统发育分析结果显示 种蚊虫的 个基 因各自形成明显的支系被命名为组 埃及伊蚊和致倦库蚊分 别有 和 个基因形成了一个不为按蚊所共有的特殊支系被命名为组 替换率结果显示中华按蚊与冈比亚按蚊同源基因对的值都小于 说明家族基因在进 化过程中主要是受到纯化选择作用 结论本研究为蚊虫特别是中华按蚊基因组家族基因 提供了信息框架为进一步开展该家族基因的功能研究奠定了基础 关键词 中华按蚊 化学感受蛋白 全基因组鉴定 生物信息学 基因特征 系统发育 中图分类号 文献标识码 文章编号 基金项目 两江学者计划专项经费 国家自然科学基金项目 国际原子能机构项目 国家科技基础性 工作专项重点项目 作者简介 梅婷 女 年 月生 重庆开州区人 硕士研究生 研究方向为昆虫分子生物学 通讯作者 收稿日期 接受日期 期 梅婷等 中华按蚊化学感受蛋白家族基因的全基因组鉴定和特征分析