基因芯片试验设计探讨-华联生物科技.PDF

华联快讯一连三期 (7~9月 ) 为大家介绍基因芯 DD 模块之实验设计 模块之实验设计 片的实验设计种类。先为大家复习一下： A_模块 D 分析模块为有时间差或刺激因子剂量差别的 (7月 ) 为成对样品的实验设计；B 、C 模块 (8 月 ) 实验设计。以下以 C 套餐的感染后给药作为说明 为多样品实验设计，前者可找出样品间的共同或 范例。在 C 套餐的说明中我们将实验设计的变因 相异之处，后者可用来探讨样品间的关连性。本 仅限制在单纯的交互作用，但其实此类实验尚可 期再继续介绍 D 及 E 模块实验设计，分别为单因 包含时间变因，如动物养殖 /细胞培养时间、投药 子影响及多因子交互作用。 时间点、投药过程及投药后等待反应的时间等； 或刺激因子或药物剂量变因，如 LPS 投入剂量、 模組 圖示 說明 药物剂量的多寡等。以投药过程为例，此变因可 Tumor to A1 Pairwise adjacent 再细分为治疗周期与治疗持续时间。常见之治疗 Normal 周期为 5 天或 7 天为一个周期单位，而治疗持续 Control to A2 Non Pairwise Treat 时间可长达 1 个月至半年。有时也不须有治疗周 Multi 寻找共同或 期与治疗持续时间，可视研究者需要仅投药一次 B independent 差异 或数次。而无论是以上哪一种实验，基本上都必 感染后给药 C Cross Knockout and 须注意生物性重复与技术性重复的问题，例如在 interaction Knockout treat 以 LPS 感染老鼠实验中，因不可能有两只老鼠的 Time Series 随时间变化 基因表现会完全相同，有些老鼠可能在施药后会 D Analysis Dose response 马上死亡，但有些老鼠却有很强的耐受性，或是 2 factors 多种变因 操作人员量测 LPS 的剂量有些微不一，因此必须 E Time × Dose 交互作用 使用多只老鼠来降低个体性差异。 1 华联快讯 2012.09