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信息学——浙江省丽水市住院医师规范化培训考试试题精粹
一.填空题:
1、目前Internet上的生物信息学数据库种类按其功能属性可以分为基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、 生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库 以及_以上三类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库__四大类。
2、SCI的检索方法(功能)有 基本检索 、作者姓名检索、被引作者和被引文献检索、作者地址检索、刊名全称检索、复合检索等。
3、Science Online 反映当前自然科学各领域研究动态和成果的综合性杂志,刊载论文、报告、评论、简讯、新闻和书评。1997年国家自然科学基金委和美国《科学》周刊达成协议,获得了《科学在线》 在我国的网上发行权,成为中国在世界上唯一的读者不需要订阅印刷版便可免费获其网络版全文的杂志。包括:美国《科学》周刊电子版、《科学此刻》、《科学后浪》、《科学知识环境》等。
4、生物医学信息学是一门有关处理生物医学(和人类健康)相关的信息、数据以及如何解决问题和作出决定的科学。生物医学信息资源按载体形态可以分为 印刷型资源 、 缩微型资源 、 视听型资源 、 数字化资源 ,其中 印刷型资源 和 数字化资源 是目前生物医学领域的两大主流信息资源。
5、检索过程中的主题分析的基本要素主要可以分解为①分析课题内容实质;②析出误假主题概念所表征的真实概念;③析出主要概念,排除无关概念和复杂概念;④析出被隐匿的主题概念;⑤用主题概念宽泛而检索意义不大的主题词。
6、MeSH由字母顺序表、树状结构表、副主题词表及当年新增词4个部分组成。(/mesh/meshhome.html)
7、PubMed是NLM下属的美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发研制的Entrez是生物信息集成化数据库检索系统,它包括有:核酸数据库;蛋白质数据库;结构数据库;全基因数据库;PopSet;OMIM等。PubMed的检索功能主要有:逻辑组配检索、自动转化提问词、截词检索、作者姓名自动截词检索、有摘要或全文记录检索 、字段检索等。
8、中国生物医学文献光盘数据库(CBMdisc)收录内容涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域15分)
1、请列出五种以上生物医学主流全文型检索工具。(答案要点:
1)Science Direct OnSite (SDOS);2)Springer Link ;3)EBSCO; 4)Kluwer Online;5)UMI Medical Library;6)维普中文期刊全文数据库;7)万方医药全文数据库;8)中国期刊全文数据库,答对五种即得分)P69~78
2、⑴查准率的调整方法主要有哪些?(答案要点:
主要有1)采用主题词及主要主题词检索;2)采用副主题词限制检索;3)采用in把某个检索细限制在某个字段,进行限制字段检索;4)采用and、with、near缩小检索范围;5)采用双引号、等号实施精确匹配检索);6)若已知作者、化学物质名、化学物质登记号、基因符号等,可直接检索;7)采用多途径组配检索。答对五种即得分)
⑵ 例举5种提高查全率的检索策略。①利用上位词检索,或采用 Explode(扩展)指令对下位词扩展检索;②采用“or”连接同一概念的不同表达方式(同义词、相关词、单复数、形容词等);③采用“*”截词符检索具有不同后缀的同一概念;④采用“?”代替一词中某一字母的变化形式;⑤利用Index进行同类词检索;⑥从显示记录中选词并检出结果,进行文中词检索;⑦采用多途径检索。
3.欲检索某一核酸序列,可以选择哪几个数据库,并对三个主要数据库进行说明。
GenBank 、EMBL 、 DDBJ 是三大国际核酸序列数据库。
⑴GenBank:是NCBI的核苷酸序列和蛋白质序列数据库,也是NIH的基因系列数据库,它是所有公开的DNA序列的集合。最常用的查询是BLAST(序列局部相似性查询)。
⑵EMBL:由欧洲分子生物学实验室EMBL创立,建于1980年,是欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA学列数据库,每年发行4版。
⑶DDBJ:由日本国立遗传学研究所遗传信息中心创立,建于1984年。上述三个数据库每天交换数据,同步发展,共同构成了国际核算序列数据库。
⑷SRS:英国EBI的序列检索系统,由欧洲生物信息研究所开发,是目前生物信息学领域中常用的数据库检索系统。是一个开放的数据库查询系统,不同的SRS查询系统可以根据需要安装不同的数据库,目前共有300多个不同数据库安装在世界各地的SRS服务器上。
⑸ENTREZ:是NCBI的蛋白质和核苷酸数据库,是由NCBI推出的基于网络的数据库检索系统。包括核酸、蛋白质和PubMed文献数据库。
⑹dbEST 序列表达标记数、Biosino数据库。
4、医学文献信息获取渠道有哪些?
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